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κ-演算建模λ噬菌体的生活周期.pdfVIP

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第41卷第1期 上海交通大学学报 V01.41No.1 OF UNIVERSITY Jan.2007 2007年1月 JOURNALSHANGHAIJIAOTONG 文章编号:1006—2467(2007)01—0042—03 彤一演算建模久噬菌体的生活周期 李 丹, 张敏, 董笑菊 (上海交通大学计算机科学与工程系,上海200240) 摘要:扩演算是一种描述生物蛋白质分子间相互作用的形式化语言.介绍了扩演算的语法、语义 以及A噬茵体侵蚀大肠杆菌细胞的生物过程,提出了用扩演算建模生物过程的一种方法,给出翻译 规则,并在规则的指导下建模具体的生物过程.根据模型的特点,分析和研究扩演算的表达能力和 表达特点. 关键词:扩演算;A噬茵体;生活周期;蛋白质 301.2 中图分类号:TP 文献标识码:A 彤一CalculusModelfortheL ofLambda ife-Cycle Phage LI ZHANG Dan, Min,DONG Xiao-j铭 Scienceand 200240,China) (Dept.ofComputer Eng.,ShanghaiJiaotongUniv.,Shanghai isaformal todescribethereactionsbetween molecules.This Abstract:盯-calculus paper language proteins thesemanticsofx-calculus.the ofA theEsche— introducedthe and eroding syntax biologicalprocessphage a of the onthe of richiaColi(E.Coli),andmethod study proposed modelingbiologicalprocesses.Based model。aseriesofruleswere andusedtomodelthe tothe biological given process.According ticsofthe also andstudiedtheabilitiesand ofthecalculus. model,thepaperanalyzed properties words:x-calculus;Aphage;life—cycle;protein Key 用计算机科学理论中的模型形式化建模生物系 随着系统的演化,位点的状态发生变化,从而使蛋白 统是目前交叉研究的一个方向,其

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