基于图像处理的afm细胞形态参数的自动获取 based on image processing technique to acquire morphological parameters of afm imaged cells.pdfVIP

第27卷第1期 电子显微学报 V01．27．No．1 2008年2月 JournalofChineseElectron 2008-0口 MicroscopySociety 文章编号t1000．6281(2008)01．0057．07 基于图像处理的AFM细胞形态参数的自动获取 何振宇1，张森文，蔡继业3 (1．华南理工大学电子与信息学院，广东广州510641；2．暨南大学应用力学研究所， 3．暨南大学化学系，广东广州510632) 摘要：细胞形态参数的准确获取对于临床诊断具有重要的意义。本文基于图像处理技术，采用MATLAB图形用 户界面(GUI)开发了一个自动获取AFM细胞形态参数的软件平台，包括图像增强、图像分割、图形修饰、形态参数 计算等功能。针对常见的细胞粘连现象，提出了一种改进的分水岭算法，即先将二值化后的图像进行距离变换， 然后采用形态学开重构运算对距离变换图进行重构，最终用标准分水岭算法分割重构图。实验结果表明，该方法 能够有效防止过分割现象。此算法不仅对细胞图像有效，对其它近似圆形的颗粒图像亦适用。 关键词：形态参数；分水岭；过分割；灰度重构 文献标识码：A 中图分类号：TP312；Q．334 force 原子力显微镜(atomic 算法分割重构图。从而有效地防止过分割现象。并 microscope，AFM)… 近年来广泛应用于生命科学技术领域尤其是细胞等 基于图像处理技术，采用MATLAB图形用户界面 微观粒子的表面形态特征的研究。长期以来，细胞 (GUI)开发了一个自动获取AFM细胞形态参数的软 形态特征的分析一直是研究生物细胞学和病理学的 件平台。 n、 主要手段。观察和计算细胞的面积、长轴、短轴、椭 1 AFM图像的特点 圆度、等效圆直径、形状系数等参数仍然是许多疾病 临床和病理的常规检查。这些参数的准确测量，对 原子力显微镜是依靠测量探针和样品表面的作 于临床诊断有着重要意义。如何准确获取AFM细 用力成像，其硬件组成和信号通路如图fo它的工 胞图像的上述参数，是生物医学工作者面临的一个 作原理为：把探针安装在柔软且具有弹性的微悬臂 难题。目前，在原子力显微镜系统中配备的图像处 上，使探针相对于试样做扫描运动。扫描过程中，探 理软件主要包括图像的灰度直方图处理、伪彩色处 针与试样表面原子问的作用力使微悬臂弯曲，通过 理、粗糙度的平滑处理及三维形貌显示等功能，其它 检测悬臂状态的变化测得试样结构，因此不受样品 如图像增强、边缘检测、粘连细胞的分割、形态特征 导电性的影响b]。由于其成像信息是来自探针与物 参数的获取等功能在配套软件中较少涉及。但是， 质相互作用所产生的各种信息，而激光束本身具有 AFM细胞图像中常常出现细胞粘连现象，这种由多 一定的波动性，加之在成像过程中还存在各种降低 个细胞聚堆而成的细胞群通常会严重影响后续的统 图像质量的因素如电噪声、声音、外界振动、空气干 计分析，将粘连的细胞图像分割为一个个细胞的图 扰，以及控制压电陶瓷管进行三维扫描的非线性等， 像，对后续分析统计能否有效进行极为重要。分水 结果使图像质量降低¨J，因此，必须对图像进行相应 岭算法怛1是近年发展起来的一种基于数学形态学的 的处理。 图像分割方法，主要应用于颗粒相互接触或重叠时 尽管原子力显微镜的成像原理很简单，比较容 的图像分割。但存在过分割现象常常使得到的结果