苹果锚蛋白基因ANK家族生物信息学鉴定分析-园艺学报.PDF

园 艺 学 报 2013 ，40 （6 ）：1021 –1032 http: // www. ahs. ac. cn Acta Horticulturae Sinica E-mail: yuanyixuebao@126.com 苹果锚蛋白基因ANK 家族生物信息学鉴定分析 1 2 3 1 1,* 2,* 许瑞瑞 ，张世忠 ，宿红艳 ，刘春香 ，曹 慧 ，束怀瑞 1 2 （潍坊学院生物与农业工程学院，山东省高校生物化学与分子生物学重点实验室，山东潍坊 261061 ； 山东农业大 3 鲁东大学，山 学园艺科学与工程学院，国家苹果工程技术研究中心，作物学国家重点实验室，山东泰安 271018 ； 东烟台 264025 ） 摘 要：利用生物信息学方法对苹果 ANK 基因家族成员及分类鉴定，同时对其染色体定位、系统进 化关系及芯片表达特性进行了分析。苹果 MdANK 家族包含 351 个基因，根据蛋白结构域差异分为 16 个 类别，ANK-M 类型最为庞大，有 143 个 ANK 蛋白；苹果的 17 条染色体均有 ANK 家族基因分布，其中 第 2 条染色体上分布最多，有 36 个 ANK 基因。MdANK 编码的蛋白在 72 ~ 2 429 个氨基酸范围内，等电 点在 4.30 ~ 11.13 之间。芯片分析发现，在苹果果实成熟时期及砧木接穗互作过程中，多数 MdANK 基因 的表达都有不同程度变化。 关键词：苹果；ANK ；基因家族；生物信息学 中图分类号：S 661.1 文献标志码：A 文章编号：0513-353X （2013 ）06-1021-12 Bioinformatics Analysis of ANK Gene Family in Apple 1 2 3 1 1,* 2,* XU Rui-rui ，ZHANG Shi-zhong ，SU Hong-yan ，LIU Chun-xiang ，CAO Hui ，and SHU Huai-rui 1 （College of Biological and Agricultural Engineering，Weifang University，Key Laboratory of Biochemistry and Molecular 2 Biology in Universities of Shandong ，Weifang，Shandong 261061 ，China；College of Horticulture Science and Technology， Shandong Agricultural University ，National Research Center for Apple Engineering and Technology ，Tai’an ，Shandong 3 271018 ，China； Ludong University ，Yantai，Shandong 264025 ，China） Abstract ：ANK （ankyr