内含子的进化及基因表达调节.pdfVIP

生命的化学》2008年28卷1期 ●新进展 CHEMISTRY OF LIFE 2008，28(1 ·33· 文章编号：1000—1336(2008)01—0033—04 内含子的进化及基因表达调节 靳霞 吕占军 (河北医科大学实验动物学部，石家庄050017) 摘要：由于内含子 (intron)的进化目前还没有一致的观点，一般认为内含子的进化是基因进化的重要部分，是与 物种形成相适应的过程。内含子参与基因的组织特异性表达、蛋白质变异、基因转录等多种生物学过程。 关键词：内含子(intron)；进化；基因表达调节 中图分类号：Q39 3O年前真核细胞含有断裂基因 (split gene)的 原始生命中缺乏内含子，真核生物出现以后，内含子 发现引起人们的震惊，断裂基因由表达的外显子 是后来获得的 1。Nguyen等 1用最大似然法(maximum (exon)和不表达的内含子镶嵌构成。内含子如何进 likelihood method)分析来自七种真核生物684个正向 化，有什么生物学作用，都是近代生物学急需解决 同源基因内含子分布状态，结果支持内含子起源的晚 的问题¨ 。内含子一度被认为是无确定性质的序列， 期内含子理论。 是基因组的垃圾 (junk)，但越来越多的研究者逐渐 1．2内含子的获得与丢失 不同真核生物基因组中的 认识到内含子有重要的生物学功能 ]。内含子RNA 内含子密度在三个数量级范围内变化，这说明内含子 含多种非编码RNA(noncoding RNA，ncRNA)，包括 在进化过程中发生广泛的内含子获得 (图1)[71和／或 微RNA(microRNA)、核仁小RNA(small nucleolar 丢失 (图2)[71。关于内含子密度范围变化的一种解释 RNA)、及用于RNA编辑(RNA editing)的指导RNA 是，大的真核基因组中的内含子是从缺乏内含子的祖 (guide RNA)C~I o内含子RNA是ncRNA的重要组成 先进化而来，并且是逐渐积累的。近来研究显示一些 成分，内含子通过获得和丢失的过程，影响ncRNA 真核生物丢失很多内含子，而其它一些真核生物积累 的变异而成为真核生物物种形成的一种动力 。内 和／或获得很多内含子 1。内含子随机获得和丢失可能 含子与基因表达调节有关 1，在mRNA产生、加工 是内含子数量改变的重要因素。 和输送中有重要作用 。通过对不同生物正向同源 Roy等n 对1560个人类一小鼠和360个小鼠．大鼠 基因 (orthologs)内含子一外显子的比较分析，发现 正向同源基因的内含子一外显子结构进行分析，并通 内含子变异性超过外显子，但是也显示一定的规律 过外类群比较，即河豚与人类一小鼠、人类与小鼠．大 性。 鼠比较，发现了小鼠谱系中五个内含子丢失的证据， 1．内含子的进化 但没有发现人类内含子丢失，也没有发现人类和小鼠内 1．1内含子的起源 关于内含子的起源目前还没有一 含子获得的证据。该实验中发现内含子丢失时，其周 致性的见解，有两种主要理论，早期内含子理论认为 围的编码序列没有改变，所涉及的内含子非常短，平 内含子在原始生命中就已经存在，有利于新基因的产 均200 bp，低于哺乳动物内含子一个数量级，内含子 生；晚期内含子理论认为与现在的原核生物相似，在 丢失可能与基因重组有关。