基于玛氏骨条藻转录组的氮代谢途径解析.pdfVIP

35 5 海 洋 环 境 科 学 Vol． 35 No． 5 第 卷第 期 2016 10 October 2016 年 月 MAＲINE ENVIＲONMENTAL SCIENCE 基于玛氏骨条藻(Skeletonema marinoi) 转录组的氮代谢途径解析 1 ，2 2 ，3 2 ，3 1 ，2 4 5 荆晓丽 ， 米铁柱 ， 甄 毓 ， 付保忠 ， 李成峰 ， 于志刚 (1. ， 266003 ;2. ， 中国海洋大学海洋生命学院 山东青岛 海洋环境与生态教育部重点实验室 山东青岛 266100 ;3. ， 266100 ;4. ， 中国海洋大学环境科学与工程学院 山东青岛 国家海洋局东海监测中心 上海 200137 ;5. ， 266100) 海洋化学理论与工程技术教育部重点实验室 山东青岛 : 、 (Skeletonema 摘 要 本研究分别选取了不同生长时期 不同温度培养以及低硅条件培养的玛氏骨条藻 marinoi) ， Illumina Hiseq 2000 ， 39 ，098 。 NＲ 以 平台进行转录组高通量测序分析 共获得 个转录本 通过 注 释、GO 注释和KEGG 通路注释等一系列生物信息学手段对该转录组进行了基因注释和代谢途径分析。 ， 20 6 。 38 在此基础上重点分析了玛氏骨条藻的氮代谢途径 发现共存在 种酶和蛋白及 条相关代谢途径 对 ， 。 个编码这些酶的基因序列比对结果表明 其与假微型海链藻同源基因具有较高的一致性 同时对这些样 ， : 品进行数字基因表达谱分析 获得不同生长时期氮代谢途径中酶和蛋白的编码基因的差异表达情况 与对 ， ( 、 ) 数期相比 在稳定期参与硝酸盐同化过程的两种酶 硝酸盐还原酶 亚硝酸还原酶 的基因和参与氨氮代 ( ) ， 谢的两种酶 氨甲酰磷酸合成酶和氨基甲酸激酶 的基因均有明显的上调表达 这是玛氏骨条藻对所处的