真核生物TATA框的折叠结构特征.pdfVIP

维普资讯 动 袖 学 研 究 1998，19 (2)：l3l—l36 CN 53一l04O／Q ISSN 0254-5853 z00J0gicalResearch 真核生物 TATA框的折叠结构特征 罗 红 刘次垒。 曹 槐。 (① 云南大学现代生物 中心 65~91) (② 中国科学院昆明动物研究所细胞与分子进化开盐实验宣 650223) 摘要 通过对真核生物 142个基因的部分启动子序列的折叠摸型进行分析研究，结果表明， 这些基因的 TATA框在折叠结构摸型 中所表现的茎环结构特征有利于与反式作用因子和 RNA 聚台酶的识别及其相互作用。 关键词 TAT — —A，埋 真≠女}习 中围分类号 Q754 许多编码基因的准确转录都依赖TATA框 (Breathnach等，1981)。在原核生物中， RNA转录的起始过程是 RNA聚合酶首先与启动子一35区域的识别信号相互作用，再与 一 lO区域的 Pribow (相当于真核生物的TATA框)的结合位点相结合，然后移到转录起 始位点引发 RNA的合成 (孙乃恩等，1993)。对原核生物中的大肠杆菌 54个启动子的折 叠结构研究结果表明，大肠杆菌启动子中的Pribow位于折叠结构的单链区与螺旋区的结 合处，有利于RNA聚合酶的识别和相互作用(乐树云等，1985)。 在真核生物 中，RNA转录的起始过程现在还不很清楚，其原因在于转录机构十分复 杂。从启动子结构方面看，它涉及到许多启动子的转录因子。在众多的转录因子中，它们 之间的关系还没有明确的结论。但对启动子部分的TATA框功能的研究一直是人们关注 的焦点。随着细胞生物学、分子生物学和基因工程的研究和实践的进展，已从理论和实践 两方面对真核生物 TATA框在转录过程 中的作用进行 了有意义的探索。我们知道， TATA框是绝大多数真核生物正确表达所必需的，在没有TATA框的基因表达过程中可 能存在某种替代机制，这种机制可能涉及到某种蛋 白质因子与某种 DNA序列的共 同作 用。在真核生物中，TATA框的结构和功能类似于原核生物的Pribow，它决定了转录起 始点的选择，对转录的方向，以及转录的效率起决定作用 (Anne0Shee—Greenfield 等，1992)。TATA框是 RNA聚合酶的结合位点，RNA聚台酶与TATA框牢固结合之 巴 后才开始转录。由于反式作用因子和 RNA聚合酶具有相对固定的拓扑结构，由此推测， TATA框也应具有相适应的空问结构特征。 以往的研究结果大多是以一维线性序列或以DNA双链为对象获得的。本文立足于三 奉文 1996—10—10收到，1997-04—30修回 维普资讯 动 物 学 研 究 9卷 维结构，通过对 TATA框序列结构的大量研究给 出了在一维上不可能得到的信息。如 TATA框位于折叠结构的发夹环、内环、单链与茎的结合处、以及游离区等。 t¨