基因表达分析设置方法.docVIP

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2017-08-30 发布于重庆
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基因表达分析设置方法.doc

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基因表达分析设置方法

基因表达分析板设置方法首先打开分析软件，选择基因表达分析一项在这里举一个例子，用SYBRGREEN染料法，用GAPDH作内参，检测不同样品中LI1的基因表达差异，在这里要设置各自的标准品样品和阴性对照等信息为了方便起见，我先将所有的孔都选成unknow。然后在选上SYBR染料点Assign assay name打开如下对话框选择不同类型的样品（GAPDH或IL1），假设前两排是GAPDH，后两排是IL1，则可以在assign assays within selected wells中选择SYBR并输入GAPDH和IL1的名称，同时你可以选择一个颜色代表不同的基因。这样系统就可以分辨哪个孔是什么基因了。我用红色代表IL1 下一步是要告诉系统哪一个是看家基因，在Normalizing assay中选择GAPDH就可以了这时候原来图上的GAPDH就变成了NORM 接下来设置重复，每一个样品设置了三个重复再接下来分开看家基因和目的基因的标准品和未知样品就是把上面的unknow改成standard然后赋予相应的值再接下来区分哪些样品来自同一份组织上图中的ABCD表示标号相同是来自同一份组织，这样就把同一份组织中的看家基因和目的基因对应了起来。最后确定哪一份组织是对照样品也就是正常样品，就在well type中选择calibrator 这样板设置就完成了