2015结构生物学期末考试复习要点.docxVIP

淮海工学院研究生《结构生物学》期末考试复习要点一、名词解释 1、30nm染色质纤维：真核生物细胞核中DNA以负超螺旋的形式与组蛋白结合成核小体 (nucleosome),核小体螺旋化形成30nm染色质纤维。 30nm染色质纤维以4个核小体为结构单元；各单元之间通过相互扭曲折叠形成一个左手双螺旋高级结构，H1连接组蛋白在此过程中起重要作用。 2、蛋白质二级结构：指它的多肽链中有规则重复的构象，限于主链原子的局部空间排列，不包括与肽链其他区段的相互关系及侧链构象。指肽链的主链在空的排列或规则的几何走向、旋转及折叠。蛋白质主链是由氨基酸之间的肽键相连。组成肽键的4个原子位于一个肽平面上。由于侧链的空间位阻，肽键一般为反式构象（Pro除外）。由于蛋白质的主链构象是受限的，一连串氨基酸常常采取相同的构象，形成蛋白质的“二级结构”。 3、蛋白质结构域：在超二级结构基础上组装而成，多肽链折叠近乎球状的组装体，这种相对独立的三维实体称为结构域。蛋白质分子中具有特定结构和独立功能的结构单元。通常围绕单一疏水核心构成。 一般而言，结构域沿着多肽链依次折叠。但也会有多肽链的几个部分从一个结构域延伸出去形成另一个独立的结构域。 4、DNA聚合酶右手模型：含有聚合酶结构域和3’→5’外切酶结构域，C端缺少5’→3’外切酶结构域 。包括四指 (5’→3’外切酶结构域，核苷酸的结合与识别) ，手掌 (3’→5’外切酶结构域，DNA聚合反应活性中心) ，拇指 (聚合酶结构域，DNA结合)。5、自组装学说：还原变性的牛胰核糖核酸酶在去除变性剂和还原剂后，不需要任何其他物质的帮助，能够自发的形成正确的4对二硫键，重新折叠成天然的三维结构，并恢复几乎全部生物活性。6、分子马达:是分布于细胞内部或细胞表面的一类蛋白质，它们的构象会随着与ATP和ADP的交替结合而改变，ATP水解的能量转化为机械能，引起马达形变，或者是它和与其结合的分子产生移动。分子马达本质上是一类ATP酶。分子马达是生物体内的一类蛋白质,它们可以将化学能转变为机械能,或者将机械能转变为化学能。分子马达在细胞内利用ATP供能,产生推动力,进行细胞内的物质运输或细胞运动的蛋白质分子称为分子马达或马达蛋白7、初级转运蛋白:逆电化学势的主动转运 ，所需能量来自外源，如光反应、氧化还原反应、ATP水解等。 二、简答题 1、简述真核生物染色体的结构组成层次真核生物细胞核中DNA以负超螺旋的形式与组蛋白结合成核小体 (nucleosome) 核小体螺旋化形成30nm染色质纤维。30nm染色质纤维超螺旋化形成300nm染色质超螺旋体染色质浓缩形成700nm螺旋，即染色体2、请列举至少4种RNA结构模体及其特点茎环或发夹结构。GNRA四环结构 (GNRA tetraloop)内环 (internal loop)：内环有很多不同的构象，内环通常是蛋白质的结合位点。假结 (pseudoknot)：重要的RNA功能模块和蛋白质分子识别基础。K转向 (Kink-turn)：重要的RNA识别蛋白模体。凸起 (bulge)：确定茎环结构取向。A-小模体 (A-minor motif):远程相互作用 ,RNA三级结构中最重要的结构组件3、什么是分子伴侣？它与酶的区别是什么？（1）从功能上定义的，一大类相互之间没有关系的蛋白质，其共同功能是帮助其他蛋白质的结构在体内进行非共价的组装和卸装，但不是这些结构在发挥其正常生物学功能时的永久组成成分。（2）区别1.分子伴侣对靶蛋白布局有高度专一性，同一分子伴侣可以促进多种氨基酸序列完全不同的多肽链折叠成三维结构、性质和功能都并不相关的蛋白质2、它的催化效率很低。行使功能需要水解ATP，以改变其构象，释放底物，进行再循环3.分子伴侣有时也只是阻止肽链的错误折叠，而不是促进其正确折叠成为成熟的有完整功能的蛋白质4.分子伴侣辅助的是“非共价”，区别于催化新生肽进行翻译后共价修饰的酶。 4.　多能性（胁迫保护防止交联聚沉，转运，调节转录和复制，组装细胞骨架）5. 进化保守性为什么碳酸酐酶的催化速率可以高达106/s？折叠方式完全不同；亚基数量不同；活性位点位置不同。为了保证反应快速进行，活性中心既不能强烈结合底物或产物，也不能进行大的构象变化。α型Zn离子附近199位Thr的“守门员”羟基H原子与106位Glu形成氢键，使底物HCO3-只能以-OH基团中的质子化氧与Zn离子结合。Zn-OH-对CO2进行亲核攻击，负电荷转移到离Zn较近的O原子上，形成HCO3-。HCO3-通过中性氧与Zn的结合较弱，很快被水分子取代，自身被释放。催化二氧化碳的水合反应及逆反应： Zn-H2O = Zn-OH- + H+H+ + His = His-H+His-H+ + Buffer = His + Buffe