加速基因表达发临床工具的转化.PDFVIP

开发基因表达标志物 Biology for a better world 加速基因表达发现向临床工具的转化 患者的时间并不多，对于临床研究人员也是如此，他们力求将新的发现快速转化成有效 的临床工具，以改善医疗保健。 通过关注“有效的转录组”，如今的研究人员正在寻找临床上有用的基因表达标志物。 这对于复杂疾病特别重要，因为表达标志物是细胞与环境的复杂相互作用的实时反映。 幸运的是，目前有大量的工具能轻松地平行测定数千个基因的表达，让研究人员以临床 实践所需的特异性和灵敏度生成标志物。 在发现和验证供临床使用的表达标记时，选择适当的技术至关重要。这些选择所带 来的方案必须是可靠的，与临床样本类型兼容，可扩展，周转快，并且具有成本效 益。Affymetrix 在提供工具并与检测开发商合作上具有丰富的经验，如SkylineDx、 Response Genetics, lnc. 和Medical Prognosis Institute （MPI）等，他们开发基于基 因表达芯片的检测，正改变当今的临床实践。 每次都能获得一致的结果 转化医学研究人员需要利用能产生一致结果的技术来开发标志物，技术选择不当是临床 验证失败的主要原因。 目前主要有两种技术可用来发现复杂的表达标志物，它们是芯片和RNA-Seq。近期关于 RNA-Seq 技术的研究表明，对于不同样本以及不同平台和地点的数据，RNA-Seq 可能 1 产生巨大的变化。 这是由于文库制备方法、测序深度和分析方法的不同和偏向。由于 这种变化，RNA-Seq 在临床应用中的潜力有限。相比之下，Affymetrix 的表达芯片是 成熟的发现工具，带来了成功的转化研究所需的一致、可重复结果。 /custom/Affymetrix/nextgenscientist/index.htm 开发基因表达标志物 Biology for a better world 切实有效的技术 – 即使是困难的样本 利用这些工具来加速您的转化研究 在发掘新的临床生物标志物时，始终要牢记最终的应用，特别是 哪些样本将被使用。在开发过程中精心选择合适的样本类型，研 究人员也就避免了将体外模型上的标记转移到人类临床样本时产 从各种类型临床样本中发掘可靠的表达标志物 生额外的可变性、时间和成本，这样还提高了验证成功和临床认 ® 可的机会。 GeneChip Human Transcriptome Array 2.0 然而，从常见的临床样本中提取出可靠的复杂基因表达数据却很 免费的分析软件，从数据到见解仅需几分钟 有挑战性，如小的活检样本、福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）样 本和血液组织。此外，这些样本往往数量有限，这让许多技术难 Transcriptome Analysis Console (TAC) 3.0 Software 以高效处理。Affymetrix 的GeneChip® 转录组分析能够高效处 理广泛的常见临床样本，且只需要皮克级的起始RNA。 看看谁在利用 Affymetrix 的技术开发临床检测 Powered by Affymetrix™ (PbA) Program 开发更快速、更高效的检测 以基因组学为基础的检测能否通过临床认可标 当分析进入临床应用时，开发一种能在几天而不是几周或几个月