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摘要
有良好的药用前景。
立了相关的预测模型。其中,CoMFA模型的交叉验证相关系数(q2)为0.592,
非交叉验证相关系数(r2)为0.982,标准偏差(SEE)为0.094,F值为l19.761;
果表明,获得的CoMFA和CoMSIA模型具有良好的预测能力,可以应用于指导
该类化合物的设计。通过分析CoMFA和CoMSIA模型可发现,在内酯环上引入
体积较大、电正性强的亲水取代基团,在Cl位引入体积较小的电负性的疏水基
团,在C19位引入体积较大、电正性强的氢键受体,均有利于化合物活性的提
高。 . ;
此外,我们对dittyostatin进行了分子对接,并对分子对接后得到的
dictyostatin和微管蛋白复合物进行了分子动力学模拟,得到比较接近实际情况的
复合物结构,最后我们分析了dictyostatin与微管蛋白之间的具体作用方式。分
析结果表明:dictyostatin与微管蛋白主要通过氢键作用和静电作用相结合。’
Dictyostatin和微管蛋白之间共形成3对氢键,分别是C1位的酮基氧原子与苏氨
酸273的氢原子形成了一对氢键、C9.位的羟基氧原子与组氨酸226的氢原子形
成了一对氢键、C19位的羟基氢原子与甘氨酸359的氧原子形成了一对氢键;:
dictyostatin电正性比较强,微管蛋白活性腔的电负性很强,它们之间有很强的静
’
电作用。
关键词:discodermolide
dictyostatin三维定量构效关系分子对接分子动
力学模拟
ABSTRACT
andanti-tumor
on novel
and tubulin,are
Discodermolide
dictyostatin,acting
have pharmaceuticalprospect.
compounds.Theygood
Three.dimensionalstructure-activity
quantitative
anditsderivatives
carriedoutondiscodermolide usingcomparative
stIJdieswere
molecular indices
molecularfield similarity
analysis(CoMFA)andcomparative
withtheCoMFA
best wereobtained steric,
predictions
analysis(CoMSIA).The
validation errorof
electrostaticfields(1eave.one.out rZ=0.982,standard
q2=0.592,NO
19.76 withtheCoMSIAcombinedelectrostatic,
estimate=0.094,F=11),an
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