SELDI技术联合MATLAB软件预测FOLFOX4方案治疗大肠癌敏感性的探究报告.pdfVIP

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SELDI技术联合MATLAB软件预测FOLFOX4方案治疗大肠癌敏感性的探究报告

山西医科大学硕士学位论文 SELDI 技术联合 MATLAB 软件预测 FOLFOX4 方案治疗大肠癌敏感性 的研究报告 研究生:吉利娜 专业:肿瘤学 导师:裴毅 中文摘要 目的:探索用 SELDI 技术联合 MATLAB 软件预测和判断 FOLFOX4 方案治疗大肠癌疗效的可 行性。 方法:留取FOLFOX4方案化疗前60名有可观察指标的大肠癌患者(男性38例、女性22例) 血清,行 SELDI-TOF-MS 技术 (surface-enhanced laser desorption / ionization time of flight mass spectrometry 表面增强激光解析离子飞行时间质谱技术)检查,描绘其指纹图谱为分析用。第一阶 段工作:12 名大肠癌患者入组,FOLFOX4 方案治疗后根据实体瘤疗效评价标准将这些患者 分成:稳定组(SD)、无效组(PD),采用ProteinChip 3.2.0软件和Biomarker Wizard 3.1 软件分析两组间的差异蛋白质指纹。用 MATLAB 软件进行多项式曲线拟合得出每个差异指 纹的拟合曲线及曲线方程,修正界定指纹;第二阶段工作:48 名准备接受 FOLFOX4 方案化 疗的大肠癌患者入组,接受三个周期的FOLFOX4方案化疗后,将化疗前的指纹根据第一阶 段预测疗效界定标准将患者分成符合指纹人群和不符合指纹人群,分析按实体瘤疗效评价 标准分成的 SD 和 PD 组患者指纹中相同质/核比(M/Z)的蛋白质含量(丰度)与实际疗效的相 关性,并界定能反映疗效的指纹丰度。 结果:(1)有 3 个差异蛋白质峰(M/Z为 2868、1204、4176)在稳定组和无效组中有统计学意 义(p 0.05) ,基线漂移(drift )±50H+ 。用MATLAB软件进行多项式曲线拟合得出每个差异 + 指纹的曲线且曲线方程均呈线性的函数关系。因此,M/Z: 2868 ±50H 丰度下调,M/Z : + + + 1204±50H 、4176 ±50H 丰度上调与疗效提高呈正相关,反之亦然。(2) 以M/Z :2868±50H 丰度<10 归为稳定组,反之归为无效组,稳定组中指纹符合率为 66.7%,无效组中指纹符 +丰度>10 归为稳定组,反之归为无效组,稳定组中指纹 合率为 71.4%; 以M/Z :1204±50H 符合率为 74.1%,无效组中指纹符合率为 81%; 以M/Z :4176±50H+丰度>40 归为稳定组, 反之归为无效组,稳定组中指纹符合率为 70.4%,无效组中指纹符合率为 81%。 结论:借助于蛋白质指纹技术及MATLAB软件预测FOLFOX4 方案治疗大肠癌的耐药是可 行的。经SELDI检查,其指纹图谱M/Z:2868±50H+ + + 、1204±50H 、4176±50H 为预测FOLFOX4 + + 方案治疗大肠癌敏感性的指纹标识,其M/Z:2868±50H 丰度<10、1204±50H 丰度>10、 + 4176±50H 丰度>40 为预测FOLFOX4 方案治疗大肠癌可获得稳定的标识指纹;其M/Z: 2868±50H+ + + 丰度≥10、1204±50H 丰度≤10、4176±50H 丰度≤40为预测FOLFOX4方案治疗 大肠癌无效的标识指纹。 关键词:SELDI;

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