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HIV-1整合酶链转移反应抑制剂的荧光筛选方法.PDF

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HIV-1整合酶链转移反应抑制剂的荧光筛选方法

中国生物工程杂志 ChinaBiotechnology,2013,33(1):6771 HIV1整合酶链转移反应抑制剂的荧光筛选方法 1 1 1 2 1 1 1 1 刘 斌  刘 昕  李 杉  何红秋  张小轶  谭建军  陈慰祖  王存新 (1北京工业大学生命科学与生物工程学院 北京 100124 2重庆市科学技术研究院重庆生物医药与器械研究中心 重庆401123) 摘要 整合酶被认为是抗HIV1药物研究的理想靶点之一。为了建立便捷高效的整合酶链转移 反应抑制剂筛选方法,首先将 HIV1整合酶原核表达载体pNLIN转化入大肠杆菌感受态细胞 BL21(DE3)进行原核表达,并用镍琼脂糖凝胶进行亲和纯化,获得了纯度和活性均较高的整合酶 重组蛋白;然后设计了生物素标记的供体DNA和FITC标记的靶DNA,用链霉亲和素磁珠捕获反 应体系中的DNA产物;最后用荧光分析仪检测DNA产物的荧光信号,并计算待测样品的抑制率。 用已知整合酶抑制剂S1360和MK0518对筛选方法进行了验证,测定结果与已有实验数据相当, 表明本筛选方法能够有效应用于HIV1整合酶链转移反应抑制剂的筛选。与现有的整合酶链转 移反应抑制剂筛选方法相比,本筛选方法步骤更为简化、耗时更短、成本更低。 关键词 HIV1 整合酶 链转移 抑制剂筛选 中图分类号 Q819   整合酶(integrase,IN)是HIV1生命周期中的关键   整合酶发挥其整合功能主要包括3′加工与链转移 酶之一,其主要作用是将 HIV1的遗传物质整合入宿 两个反应步骤:将HIV1cDNA的3′端切去GT二核苷, 主细胞的基因组,在 HIV1生命周期中发挥着重要作 暴露出CA末端,即3′加工;将宿主细胞DNA切开,并通 用;并且由于人体中没有整合酶的类似物,故整合酶被 过磷酸二酯键把HIV1cDNA的3′端与宿主细胞DNA [13] [910] 认为是抗 HIV1药物研究的理想靶点 。在逆转录 的5′端连接,即链转移 。目前已有的整合酶抑制剂 酶抑制剂、蛋白酶抑制剂等传统抗 HIV1药物耐药性 主要是通过抑制整合酶的链转移反应活性来发挥作用 [45] [11] 问题日益严重的情况下 ,围绕整合酶等新型靶点的 的 。因此,发展便捷高效的整合酶链转移反应抑制剂 药物研究越来越受到人们的重视。虽然以整合酶为靶 筛选方法对于整合酶抑制剂的研发具有重要的意义。 点的药物研究已有二十多年的历史,但目前仅有一种   在前期工作中,利用磁珠捕获 DNA技术,建立了 药物——— [3,6] 磁珠式高通量筛选方法并应用于整合酶抑制剂的筛 Raltegravir(雷特格韦)被FDA批准上市 , 远不能满足治疗艾滋病的迫切需求;并且随着整合酶 选[12]。针对这一方法步骤繁琐、耗时长、成本较高的缺 抑制剂日益广泛的临床应用,也不可避免地出现了耐 点,本研究在原有筛选方法的基础上对其进行了改进, 药性问题,因此亟需研发新型 HIV1整合酶抑制剂来 直接将FITC荧光基团标记在靶DNA上,达到了简化步 [78] 骤、缩短时间、降低成本的目的,可以更好地服务于整 应对艾滋病的治疗 。   整合酶由HIV1的pol基因编码,全长288个氨基 合酶抑制剂的研发。 酸残基组成,分为3个相对独立的结构域———N端结构 1 材料与方法 域、核心区结构域和C端结构域。 1.1

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