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珍稀濒危树种毛红椿微卫星DNA分离及SSR反应体系优化.pdf
China B iotechnology, 2006, 26( 12): 50~ 55
DNA
SSR*
1 2 1** 1 1
刘 军 孙宗修 陈益泰 何贵平 吴天林
( 1 311400 2 310006)
以江西宜丰种源毛红椿为材料, 成功提取其基因组 DNA利用改良的链亲和素磁 法亲
和捕捉出毛红椿基因组微卫星 DNA片段,并构建了富含微卫星的基因组文库从构建的基因组
文库中随机挑选了 63 个单克隆进行测序, 其中50 个单克隆成功测序, 含有微卫星的单克隆有 18
个,并根据测序结果设计并合成 SS 引物 18对利用所合成的引物优化 SS 反应体系, 对影响
SS 反应的各 个因子进行了探讨确定了模板 DNA 最适浓度为 30ng; dNTP的最适浓度为 0.
3mmol/L; 0. 3Lmol/L是引物在反应体系中的最合适浓度建立了重复性好稳定性好的 SS 反
应体系, 为下一步进行毛红椿群体遗传结构和遗传变异研究提供了技术支持
毛红椿 微卫星 链亲和素磁 SS 反应体系
Q819
[T oona cilia ta var. pubescens ( Franch. ) ,
Hand. ], [ 5, 6]
[ 1]
, ,, / 0, DNA,
,,, DNA
, ,
,,
, DNA( DNA)
[ 2, 3]
[ 4]
0. 04% ~ 12% ,
,
DNA ,
, [ 7]
,
,
: ( 1)
DNA ( single sequence
DNA ; (2) DNA
repeat, SS ), 1~ 6
SS ; ( 3)
DNA ,
SS , SS
[ 4]
,
SS DNA
,
1
: 2006-07-28 : 2006-10-24
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