草莓镶脉病毒粒子提取及电镜观察方式分析.docVIP

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草莓镶脉病毒粒子提取及电镜观察方式分析

草莓镶脉病毒粒子提取及电镜观察方式分析  摘要:从受感染的草莓(Fragaria sp)植株中提取了草莓镶脉病毒(Strawberry vein banding virus,SVBV)粒子并对其进行了电镜观察。用CTAB法从草莓叶片中提取总核酸,设计SVBV外壳蛋白基因特异性引物,利用PCR方法对杭州地区的草莓镶脉病毒感染情况进行检测。检测结果表明,在杭州地区大田种植的草莓中存在SVBV感染现象。从4株受感染草莓植株中分离克隆了SVBV的CP基因片段并测序;序列比较分析发现它们与已报道的美国SVBV分离物的CP基因(序列号NC_001725)核苷酸同源性为91%。利用差速离心法从上述草莓植株的叶片中提纯SVBV病毒,在透射电镜下观察到SVBV病毒粒子呈球形,直径约为40~55 nm。  关键词:草莓镶脉病毒(SVBV);PCR检测;病毒提取;电镜观察  中图分类号:S432.4+1;S431.192 文献标识码:A 文章编号:0439-8114(2014)18-4313-03  草莓镶脉病毒(Strawberry vein banding virus,简称SVBV)在世界上分布广泛,对草莓(Fragaria sp)危害较为严重,也是中国草莓生产的主要病毒病害之一,在吉林、河南、河北、辽宁、山东等地区均有发生[1,2]。SVBV在分类上属花椰菜花叶病毒(Caulimoviruses,CaMV),是一种双链DNA病毒,以半持久性方式通过蚜虫或嫁接传播。SVBV侵染可削弱草莓生长势,降低产量及品质;而与其他病毒或细菌、真菌复合侵染则会造成严重病害发生,给草莓的生产带来严重损失[3,4]。  Petrzik等[5]1998年测定了SVBV美国加州分离物的全基因组序列,并在此基础上发展了该病毒的PCR检测。目前,国内外众多研究者已利用PCR方法检测了不同的SVBV分离物[6-12]。研究表明,由于SVBV来源、地域不同,基因组存在着分子变异,分子检测方法也有所不同。其中,外壳蛋白在SVBV中的保守性较好,不同地区中SVBV不同分离物外壳蛋白基因间分子变异较小,通常作为PCR检测的首选区域。  虽然已对SVBV建立了高效、灵敏的PCR检测方法。但在开展大规模病毒调查时,血清学检测手段则更加简单和实用。目前SVBV仍无商品化的抗血清检测试剂,酶联免疫吸附测定(ELISA)检测较难实施。本研究用超速离心法从感染草莓镶脉病毒(SVBV)的草莓叶片中提纯SVBV病毒,为进一步制备SVBV抗血清和单克隆抗体提供有效的抗原基础。  1 材料与方法  1.1 材料  从浙江杭州地区采集带疑似病症和无症状草莓植株,盆栽种植于大棚,选取新鲜草莓叶片作为试验材料。草莓品种为红颊。  1.2 方法  1.2.1 病毒检测  1)草莓叶片总核酸提取 参照文献[11]采用改进的CTAB法抽提草莓总核酸。将少量草莓叶片在液氮中迅速研碎,取约50 mg粉末加入盛有500 mu;L CTAB提取缓冲液(2% CTAB;100 mmol Tris, pH 8.0;20 mmol EDTA;1.4 mmol NaCl;使用前加入2%beta;-巯基乙醇)的1.5 mL Eppendorf 管中,65 ℃水浴20 min。用等体积氯仿/异戊醇(24︰1)抽提2次,上清液中加入1/10体积的3 mmol/L NaAc(pH 5.2)、2.5倍体积无水乙醇,反复颠倒数次,取沉淀。70%乙醇洗涤沉淀2次,放置在超净工作台上吹干,加入50 mu;L DEPC水溶解。用紫外分光光度计测定其OD260 nm。  2)PCR反应体系 根据GenBank中的SVBV基因组序列,参照文献[12]设计同源引物B1F(5prime;-GAATGGGACAATGAAATGAG-3prime;)和B1R(5prime;- GTGAGGAGAACTTAGGACA-3prime;)。所用引物由上海英骏生物工程技术服务有限公司合成。PCR反应体系总体积为20.0 mu;L,其中包括模板DNA 1.0 mu;L、引物(10 mu;mol/L)0.5 mu;L, Taq DNA聚合酶(5 U/mu;L) 0.2 mu;L,dNTP(10 mmol/L) 0.4 mu;L,10times;PCR Buffer(含 25 mmol/L MgCl2) 2.0 mu;L,ddH2O 13.4 mu;L。所用试剂购于宝生物(大连)生物工程有限公司。扩增程序为: 94 ℃ 预变性3 min;94 ℃变性1 min,53 ℃退火30 s,72 ℃延伸30 s,共35个循环;72 ℃延伸7 min,4 ℃保存。  3)目的片段的克隆及测序 利用琼脂糖凝胶回收试剂盒[生工生物工程(上海)股份有限公司产品

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