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群体遗传学研究中的数据处理方法!rapd数据的amova分析
生物多样性! ## ，! （$ ）：$% ’ $$$ ! ! ! ! ! ! !
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群体遗传学研究中的数据处理方法 #
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$%’ 数据的%()*% 分析
张富民! 葛! 颂
（中国科学院植物研究所系统与进化植物学重点实验室，! 北京! (###)% ）
摘要：近年来，*+,- 数据和 +./0+ 分析广泛地应用于群体遗传学和保护遗传学研究。然而，由于 *+,- 标记具
显性特点，加上目前进行+./0+ 分析所依赖的*+,-1234567 软件不完善，使得对 *+,- 数据进行 +./0+ 分析时
存在许多不足。本文介绍了+./0+ 分析的基本过程，同时引入一个新的程序 -89+ 用以替代 *+,-1234567 ，并详
述了将 -89+ 与:;+./0+ 联用，对 *+,- 数据进行+./0+ 分析的具体步骤与注意事项。最后，以产自中国和
巴西 个普通野生稻（!#$% ’ () *+*, ）天然群体为例，演示了对 *+,- 表型数据进行 +./0+ 分析的过程，讨论了
+./0+ 分析结果在群体遗传结构上的意义。通过对 +./0+ 算法的分析，同时比较$ 种距离系数所得 +./0+ 结
果，我们认为在进行 +./0+ 分析时选择 =;?; 距离和欧氏距离平方较为合适，而目前国内使用较多的@+88+*-
系数不适合 +./0+ 分析。
关键词：群体遗传结构，*+,-1234567 ，-89+ ，进化距离
中图分类号：A%$B ! ! ! 文献标识码：+! ! ! 文章编号：(##C D ##)$ （## ）#$ D #$% D #B
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