双亲杂交后代的遗传分析-数量遗传课题组.pdfVIP

第7章 双亲杂交后代的遗传分析 王建康 中国农业科学院作物科学研究所 wangjiankang@ 本章的主要内容 • §7.1 单环境多基因型表型数据的方差分析 • §7.2 六个基本世代均值和方差的构成 • §7.3 自交后代均值和方差的分解 • §7.4 基因间的上位性互作 §7.1 单环境多基因型表型数据 的方差分析 • §7.1.1 表型观测值的线性分解 • §7.1.2 表型离差平方和的分解 • §7.1.3 遗传效应的差异显著性检验 • §7.1.4 基因型值预测和广义遗传力估计 遗传群体及其表型鉴定 • 假定一个遗传群体由g个不同的基因型（可以看作 是个体或家系）组成，这些基因型可以来自两个或 多个亲本的某个杂交世代，也可以来自一个自然遗 传群体，还可以是一定时期推广的栽培品种或者是 种质资源库中保存的一批遗传材料等等。 • 在特定环境条件下，每个基因型获得r次重复表型 观测数据。不同基因型的平均表现或均值也不同， 每个基因型都可被看作是一个抽样总体，一个基因 型的r次重复观测数据是来自该基因型总体的一组 样本。尽管存在基因型的差异，但可以认为它们的 方差是相同的或同质的，均等于随机误差方差。 表型观测值的分布 • 用μ表示第i个基因型的均值或平均表现， i 是一个待估计的未知参数。在观测误差 服从均值是0 、方差是σε2 的正态分布，且 相互独立的假定下，第i个基因型的第k 个表型值yik则服从下面的正态分布。 y ~ ( , 2 ) N µ σε ik i 其中，i=1, 2, …, g ，k=1, 2, …, r 表型观测值的线性分解 • 用μ表示g个基因型的总平均，每个基因型 的平均表现μi与总平均μ之间的差异定义 为该基因型的遗传效应，用Gi表示。表型 值yik还可以用线性模型表示出来。 1 g µ ∑µi G ˆ (µ −µ) i i g i 1 2 y µ+G +ε ε ~ N (0, σ ) iid ik i ik ik ε 其中i=1, 2, …, g ，k=1, 2, …, r 表型方差的分解和广义遗传力 2 1 g 2 • 遗传方差 σG ˆ ∑Gi g −1 i 1 其中，g-1称为遗传效应或遗传方差的自由度 2 2 2 • 单环境表型方差的分解 σ σ +σ P G ε 2 2 • 广义遗传力H 定义为遗传方差σ 占表型方