藏汉民族线粒体基因组全序列的比较研究.pdfVIP

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  • 2017-09-11 发布于天津
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藏汉民族线粒体基因组全序列的比较研究.pdf

藏汉民族线粒体基因组全序列的比较研究

·382· ·论著· 藏汉民族线粒体基因组全序列的比较研究 顾明亮 汪业军 史磊姜枫邱梦洁林克勤 陶玉芬史荔 黄小琴刘斌褚嘉祜 【摘要】 目的以藏汉民族线粒体基因组全序列为基础,进行aaplogroup构建和系统发生分析,在全序 3730 列水平上比较核苷酸的变异,阐释可能的变异机制和蕴含的生物学意义。方法采用Ap曲edBiosysterm DNA自动测序仪分别对40名藏族和50名汉族的标本进行线粒体DNA序列测定,应用pIlre(1P}Ⅱapl6.0软件进 行全序列拼接,并以rCRS(re’i9ed㈨dgeBeference Se叮u∞ce)为标准与测定序列进行比对分析;根据MITO. MAP的标准,通过Network方法进行I-Iaplogroup构建和系统发生的分析,并结合其它方法对产生的数据进行深 入解读。结果数据分析结果显示:在系统发生上,藏汉民族90个线粒体DNA序列归类到13个mpl,v-oups, 除№以外,其它各mplog删v出现频率之间比较差异无统计学意义;通过两个民族的线粒体DNA全序列比 对,发现21个分布频率有统计学意义的变异位点,其中的5个为新变异位点;另外,对nLo叩区的5个突变位 2的分布频 点进行了单倍型构建,90个标本可分为2种Supertype,发现在藏汉民族之间Supertypel和Supertype 率均有统计学意义。结论藏汉民族在种族起源和系统发生上具有较近的母系遗传关系;在全序列有统计 学意义的位点究竟是适应性或者中性选择,抑或是一种病理性突变尚需深入的探讨。 【关键词】藏族;汉族;线粒体;基因组;测序 0fthe betweenTibetanandHan C,U C.栅删垤analysiscompletemitochondr锄genome populationMing- 慨1,M Y洳fenl,删Lil,麟伽Xiao- Ye-jun2,舢饧1,JL4NGFen92,QIUMeng-jie2,删肛批1,TAO qinl,删既扩,CHUJia-youl.1(DepartmentofMedicalC.eneacs,InstituteofMedic01Biolo彰,ChineseAcademyof Medical UnionMedical Sc诂嘲Peking College,Kunming,Yurman,650118P.R.Ch抽a);2(&咖19/nst/aaeof Genom/cs,ChineseAcado硝ofSc/ences,&枷w,101300P.R.China) Correspondingauthor:cHU Jia-you,Email:蝴@/mbc螂.com.m Toconstructthe and all ofmitochondrial 【Al】shaet】Objective haplngroupperformanalysis whole-genome蜘 inTibetanandHall of of corn. quenee Chinese.v{IriationsnucleotidemitochondrialDNA(mtDNA)wereidentifiedand Hail aredbetw鲫ltheTibetanand T11etmDNAwholese叫encesof40Tibetanand50Hartindi. t population.Methods vidualswere

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