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- 2017-10-11 发布于浙江
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SNP分型技术简介3(傅倪遄)
SNP分型技术简介;SNP;1.SNP概念;1.SNP概念;2.SNP分类;3.SNP特性;3.SNP特性;4.SNP研究意义;4.1基因组制图;4.2疾病的关联分析; 4.3药物设计和应用;4.4个体识别和亲权鉴定;5.SNP分型技术;5.1经典检测方法;5.1.1限制性片段长度多态性法 PCR- RFLP;5.1.1限制性片段长度多态性法 PCR- RFLP;5.1.1限制性片段长度多态性法 PCR- RFLP;5.1.1限制性片段长度多态性法 PCR- RFLP;5.1.2单链构象多态性法 PCR- SSCP;;5.1.2单链构象多态性法 PCR- SSCP;5.2基于PCR 的方法;5.2.1等位基因特异 PCR ( AS-PCR);5.2.1等位基因特异 PCR ( AS-PCR);5.2.1等位基因特异 PCR ( AS-PCR);5.2.1等位基因特异 PCR ( AS-PCR);5.3基于杂交荧光检测的方法;5.3.1TaqMan 技术;5.3.1TaqMan 技术;5.3.1TaqMan 技术;5.3.2连接酶检测(LDR);5.3.2连接酶检测(LDR);5.3.2连接酶检测(LDR);5.3.2连接酶检测(LDR);5.3.3基因芯片;这5个亚序列依次错开一个碱基而重叠7个碱基。
亚序列中A、T、C、G 4个碱基自由组合而形成的所有可能的序列共有65536种。
假如只考虑完全互补的杂交,那么48个8 nt亚序列探针中,仅有上述5个能同靶DNA杂交。
可以用人工合成的已知序列的所有可能的n体寡核苷酸探针与一个未知的荧光标记DNA/RNA序列杂交,通过对杂交荧光信号检测,检出所有能与靶DNA杂交的寡核苷酸,从而推出靶DNA中的所有8 nt亚序列,最后由计算机对大量荧光信号的谱型(pattern)数据进行分析,重构靶DNA 的互补寡核苷酸序列。 ;;;特点:
优点:信息量大;自动化程度高。
局限性:芯片造价高昂, 所需设备贵重, 不利于普及应用。
;5.4光谱或电子信号;5.4.1直接测序法;总结;参考文献;Thank You !;
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