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生物信息学中的生物的学、分子生物学

生物信息学中的生物学 分子生物学;内容;生物信息学中的生物学、分子生物学基础知识; 地球上的生命史;5亿年前:寒武纪大爆发,海洋中出现大量物 种,大气中氧含量剧增 4亿年前:至留纪大爆发,O2↑, 生命进入陆地 350万年前:古脊椎动物中出现猩猩科和人科 50万年前:直立人出现,“北京猿人” 3.5万年前:早期智人出现 2万年前:早期人类出现,“山顶洞人”; 生物的分类;原核生物(Prokaryote): 古细菌(Archaea) 真细菌(Eubacteria) 真核生物(Eurokaryote) 生物的进化和亲缘关系: 遗传密码统一性 基本生物化学过程一致性;Eubacteria; 噬菌体 病毒 大肠杆菌 酿酒酵母 秀丽线虫 果蝇; 糖:单糖、双糖、多糖 作用:储存能量、结构材料、分子识别 脂肪酸:储存能量、参与代谢 核苷酸和核酸: A、C、G、T→DNA、RNA 氨基酸→蛋白质; DNA复制 DNA聚合酶→DNA单链5’ →3’复制 mRNA转录:mRNA前体→剪接 蛋白质翻译 mRNA反转录→cDNA 蛋白质折叠;中心法则;基因工程和核酸研究技术简介; 限制性内切酶(Restriction Endonuclease) 限制性内切酶 + 甲基化酶 载体:质粒、噬菌体、酵母 分子克隆: 聚合酶链反应(PCR) 超速离心;阿尔伯 Wemer Arber 瑞士生物学家 巴塞尔Biozentrum大学 1929~; 凝胶电泳 琼脂糖电泳 聚丙烯胺凝胶电泳 脉冲场电泳 梯度电泳(DGGE/TGGE) 二维凝胶电泳:蛋白质电泳;16S rRNA gene PCR;聚丙烯胺凝胶电泳;分离大分子DNA的方法。 ; 1 2 3 4 5 6 7 8 9;二维凝胶电泳; 印迹法 凝胶→硝酸纤维膜→DNA探针(32P) DNA印迹法(Southern Blotting) RNA印迹法(Northern Blotting) 蛋白质印迹法(Western Blotting); Southern印迹杂交(Southern blot)是1975年由英国人southern创建,是研究DNA图谱的基本技术,在遗传病诊断、DNA图谱分析及PCR产物分析等方面有重要价值。;Northern Blotting;Western Blotting; DNA测序方法 末端终止(Sanger)法: dNTP→ddNTP 化学降解 (Maxam-Gilbert)法: 焦磷酸测序技术(pyrosequencing): ; ????????????????????????????????????;焦磷酸测序技术的反应体系: 反应底物、待测单链、测序引物和4种酶。 反应底物: 5’-磷???硫酸(adenosine- 5’-phosphosulfat,APS)、荧光素(Luciferin)。; 如果发生碱基配对,就会释放一个焦磷酸。这个焦磷酸在ATP硫酸化酶和萤光素酶的作用下,经过一个合成反应和一个化学发光反应,最终将萤光素氧化成氧化萤光素,同时释放出光信号。此反应释放出的光信号实时被仪器配置的高灵敏度CCD(Charge-coupled Device)捕获到。有一个碱基和测序模板进行配对,就会捕获到一分子的光信号;由此一一对应,就可以准确、快速地确定待测模板的碱基序列。;Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile 5.2.0.0. Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd.;GS FLX Titanium系统摒弃了传统的细菌克隆与挑选,将DNA打断成随机片段,并寻找到乳液PCR这种方法来克隆每个片段。(将DNA放入油包水的乳液中,这样就省去了反应管,并利用表面活性剂来维持乳液的热稳定性。) 一个片段 = 一个磁珠 = 一条读长 One fragment = One bead = One read;Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile 5.2.0.0. Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd.;Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile 5.2.0.0. Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd.;谢谢!

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