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第九章 微生物的进的化、系统发育
第九章 微生物的进化、系统发育与分类鉴定;1最早的生命形式 ;2进化的测量指征 ;1）做为进化时钟的大分子的条件;2）做为进化时钟的核糖体RNA ;2.2rRNA的顺序和进化 ;（2)全序列分析法
常用方法：反转录酶和双脱氧序列分析
双脱氧核苷酸：2′，3′-双脱氧核苷酸。
;
2.3系统发育树（phylogenetic tree）;Bacteria;3 细菌分类、命名和伯杰氏手册;2)种（species）
微生物没有严格意义上的有性杂交，微生物之间能否通过转导、转化、接合等途径可以做为分种的一个参考。
根据基因序列资料来分种：DNA杂交同源性在60%--70%以上，或16SrRNA序列同源性达97%以上的菌株可以定为一个种。;3.2命名
1)双命名法
属名 + 种名加词
2)三命名法
属名 + 种名加词 + (subsp或var)+亚种或变种的加词
3)泛指:某一属细菌而不特指任何一种（或未定种名）
eg:Streptomyces sp.(spp.)
4)新名的确立
《国际系统细菌???杂志》（IJSB）是对微生物进行分类和鉴定所发表的官方记录。
新名称发表时要加上所属新分类等级的缩写词：ord.nov; gen.nov; sp.nov.;3.3《伯杰氏系统细菌学手册》 ;4微生物分类鉴定的特征和技术 ;4.4氨基酸顺序和蛋白质分析
电泳图谱比较；同功酶的电泳迁移率
4.5（G + C）%与核酸分子杂交
G + C 含量相同只表明它们具有亲缘关系相近的可能性，不能说明是否同源。
4.6遗传重组
发生遗传重组的细菌之间需要存在广泛的染色体同源性。;5微生物的快速鉴定和自动化分析技术
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