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生化名解(掌握)的
第一章蛋白质的结构与功能
等电点(isoelectric point, pI) 在某一pH的溶液中,氨基酸解离成阳离子和阴离子的趋势及程度相等,成为兼性离子,呈电中性。此时溶液的pH值称为该氨基酸的等电点。
蛋白质的一级结构(primary structure): 蛋白质分子中,从N-端至C-端的氨基酸残基的排列顺序。
蛋白质的二级结构(secondary structure): 蛋白质的二级结构是指多肽链中主链骨架原子的局部空间排布,不涉及氨基酸侧链的构象。
肽单元: 参与肽键的6个原子—— Cα1、C、H、O、N、Cα2 处于同一平面,称为肽单元
α-helix:以α-碳原子为转折点,以肽键平面为单位,盘曲成右手螺旋状的结构。
螺旋上升一圈含3.6个氨基酸残基,螺距0.54nm
氨基酸的侧链伸向螺旋的外侧。
螺旋的稳定是靠氢键。氢键方向与长轴平行。
β-折叠:蛋白质肽链主链的肽平面折叠呈锯齿状
结构特点:锯齿状;顺向平行、反向平行
稳定化学键:氢键
蛋白质的三级结构(tertiary structure) : 蛋白质的三级结构是指在各种二级结构的基础上再进一步盘曲或折迭。也就是整条肽链所有原子在三维空间的排布位置。
结构域(domain) : 分子量大的蛋白质三级结构常可分割成一个和数个球状或纤维状的区域,折叠得较为紧密,各有独特的空间构象,并承担不同的生物学功能。
分子伴侣 (chaperon): 帮助形成正确的高级结构
使错误聚集的肽段解聚
帮助形成二硫键
蛋白质的四级结构(quarternary structure):蛋白质分子中各个亚基的空间排布及亚基接触部位的布局和相互作用
亚基(subunit):二条或二条以上具有独立三级结构的多肽链组成的蛋白质。其中,每条具有独立三级结构的多肽链
模体一个蛋白质分子中几个具有二级结构的肽段,在空间位置上相互接近,形成特殊的空间构象,称为“模体”(motif)
蛋白质的变性: 天然蛋白质在某些物理或化学因素作用下,其特定的空间结构被破坏,而导致理化性质改变和生物学活性的丧失,称为蛋白质的变性作用(denaturation)。
蛋白质的复性当变性程度较轻时,如去除变性因素,有的蛋白质仍能恢复或部分恢复其原来的构象及功能
盐析(salt precipitation)是将硫酸铵、硫酸钠或氯化钠等加入蛋白质溶液,使蛋白质表面电荷被中和以及水化膜被破坏,导致蛋白质沉淀。
电泳蛋白质在高于或低于其pI的溶液中为带电的颗粒,在电场中能向正极或负极移动。这种通过蛋白质在电场中泳动而达到分离各种蛋白质的技术, 称为电泳(elctrophoresis)
第二章
核酸的结构与功能
脱氧核糖核酸(deoxyribonucleic acid, DNA):主要存在于细胞核内,是遗传信息的储存和携带者,是遗传的物质基础。
核糖核酸(ribonucleic acid, RNA): 主要分布在细胞质中,参与遗传信息表达的各过程。
DNA和RNA的一级结构: 核苷酸的排列顺序,即碱基的排列顺序。
double helix model: 两条反向平行的脱氧核苷酸链绕同一中心轴,形成右手螺旋的结构。
磷酸-戊糖骨架位于外侧,两条链上的碱基以A=T、G=C相连,构成碱基平面,位于螺旋内侧。
螺距为3.4nm,旋转一周为10个碱基对。螺旋直径为2.0nm。
major groove minor groove
氢键:维持双螺旋横向稳定
碱基堆砌力:维持纵向稳定
碱基对平面与螺旋轴垂直。
基因(gene): 从结构上定义,是指DNA分子中的特定区段,其中的核苷酸排列顺序决定了基因的功能。
基因组(genome): 指细胞或生物体中,一套完整的单倍体遗传物质的总和。
反密码子(anticodon): tRNA的反密码子环上有一个由三个核苷酸构成
DNA变性: 在某些因素的作用下,DNA双链互补碱基对之间的氢键断裂,双螺旋结构松散,形成无规则线团状分子的过程。
方法:过量酸,碱,加热,变性试剂如尿素、酰胺以及某些有机溶剂如乙醇、丙酮等。
融解温度(melting temperature, Tm): 变性是在一个相当窄的温度范围内完成,在这一范围内,紫外光吸收值达到最大值的50%时的温度。其大小与G+C含量成正比。
增色效应:DNA变性时,其溶液OD260增高的现象。(减色效应)
复性: 变性的DNA在适当的条件下,两条彼此分开的DNA单链重新缔合成为双螺旋结构的过程。
退火: 热变性的DNA经缓慢冷却后即可复性,这一过程叫退火。
分子杂交: 两条来源不同的核酸单链间,因部分碱基互补,经退火处理可以形成杂交双螺旋结构。
核酸酶(nuclease): 化学本质是蛋白质, 具有序列特异性的核酸酶称位限制性的核酸内切酶
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