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Zn(Ⅱ)2Cys6锌簇蛋白探究进展
Zn(Ⅱ)2Cys6锌簇蛋白探究进展
【关键词】 Zn(Ⅱ)2Cys6锌簇蛋白 转录因子 真菌
锌指(zinc fingers)是指含有Zn2+的可与DNA相互作用的蛋白质基序(motif),含有锌指基序的转录因子是一个大家族。目前已发现10多种不同种类的锌指基序,Zn(Ⅱ)2Cys6型锌指基序就是其中的一种,其组成是CysX2CysX6CysX5-12CysX2CysX6-8Cys,此基序中的半胱氨酸与2个锌离子结合。含有此基序的转录因子被称为Zn(Ⅱ)2Cys6锌簇蛋白,仅存在于真菌中。1982年分离出的第一个Zn(Ⅱ)2Cys6锌簇蛋白是Gal4p[1,2],Gal4p是酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)半乳糖代谢相关基因的转录调节因子,在半乳糖存在下可以激活半乳糖代谢相关基因的转录。
Zn(Ⅱ)2Cys6锌簇蛋白可参与调节真菌的基础代谢、次级代谢、药物抗性及减数分裂等过程,其中对真菌次级代谢中相关的Zn(Ⅱ)2Cys6锌簇蛋白的研究将有助于了解真菌的次级代谢的调控过程。
1 Zn(Ⅱ)2Cys6锌簇蛋白的结构及其作用方式
对已知的多种真菌的Zn(Ⅱ)2Cys6锌簇蛋白的结构分析表明,从蛋白质的氨基端到羧基端分别由DNA结合域(DBD,DNAbinding domain)、调控域(regulatory domain)和酸性域(acidic region)组成。其中DBD又可分为锌指结构域(Zinc finger domain)、连接区域(linker region)以及二聚化区域(dimerization region),在二聚化区域常含有螺旋的螺旋结构(Coiledcoil)。Zn(Ⅱ)2Cys6锌簇蛋白可以单体、同源二聚体或异源二聚体的方式与DNA相互作用。个别锌簇蛋白的DBD结构域位于羧基端[3]。有时Zn2+可被其它金属离子所替代,如Cd2+可取代Gal4p中的Zn2+[4]。调控域与锌簇蛋白对靶基因的转录激活功能有关,如果缺失该区域,可能造成靶基因的表达被持续激活,即该区域可能是起到抑制转录激活的作用。羧基端的酸性域是转录激活域。
Zn(Ⅱ)2Cys6锌簇蛋白结合于目标基因的启动子区的DNA序列,所结合的DNA元件的保守序列是单个或重复的三核苷酸序列CGG[5],结合的特异性与CGG三联体的方向、三联体之间的距离及CGG周围的碱基序列有关,常见的结合序列是CGGN6CCG 或CGGN11CCG。如转录因子Leu3p(参与亮氨酸代谢的调节)和Ppr1p(参与嘧啶代谢的调节)所辨认结合的2个CGG的间距分别为4 bp和6 bp[6],按照CGG三联体的排列方向,这些DNA序列可被分为反向重复(inverted repeat)、翻转重复(everted repeat)和正向重复(direct repeat)3种类型,如图1所示(其中Hap1参与细胞色素C表达的调节)。二聚体Zn(Ⅱ)2Cys6锌簇蛋白与DNA序列相互作用的方式如图2所示。Gal4p识别位点: CGGAAGACTCTCCTCCG Ppr1p识别位点: TCTTCGGCAATTGCCGAAGA
反向重复 GCCTTCTGAGAGGAGGC 反向重复 AGAAGCCGTTAACGGCTTCT
Leu3P识别位点: TGCCGGTACCGGCTTGG Hap1识别位点:GCCGGGGTTTACGGACGATGA
翻转重复 ACGGCCATGGCCGAACC 正向重复 CGGCCCCAAATGCCTGCTACT
图1 部分锌簇蛋白识别的DNA序列,图框中是CGG三联体[6](略)
Figure 1 Zinc cluster proteins preferentially recognize CGG triplets
图2 锌簇蛋白与DNA序列的结合方式[5,6](略)
Figure 2 Model for DNA binding of Zinc cluster proteins
矩形代表二聚体相互作用区域,箭头部分代表与DNA相互作用的区域,指明CGG的方向,矩形与箭头之间是连接区。
2 酿酒酵母中的Zn(Ⅱ)2Cys6锌簇蛋白
酿酒酵母的全基因组测序表明其含有54个Zn(Ⅱ)2Cys6锌簇蛋白。通过对其中33个Zn(Ⅱ)2Cys6锌簇蛋白功能的分析发现,它们多参与氨基酸代谢、多药耐药性、减数分裂等过程的调节。
2.1 与多药耐药性相关的Zn(Ⅱ)2Cys6锌簇蛋白
酵母中的Zn(Ⅱ)2Cys6锌簇蛋白主要通过激活与多药耐药性(PDR,pleiotropic drug resistance)相关的ABC转运蛋白(ATPbindi
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