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X染色体STR基因座在同胞亲缘鉴定中应用
X染色体STR基因座在同胞亲缘鉴定中应用
作者:吴淑珍,林刻智,张洪勤
【摘要】 目的:探讨X染色体STR基因座独特的遗传方式在同胞亲缘关系鉴定中的应用。方法:应用聚合酶链式反应(PCR)、聚丙烯酰胺凝胶电泳及银染显带技术对1名未知女性个体与3名已知同胞兄妹的22个基因座进行分型,并对线粒体D环高变区作序列测定。结果:得到具有排除价值的2个X染色体基因座(DXS7132、DXS6804)和4个常染色体基因座(D1S549、D2S441、D16S539、D5S818),否定了未知个体与3名同父同母兄妹的亲缘关系。结论:X染色体基因座在男性的基因组中呈单倍型形式存在,特别适用于法医学实践中在父母缺如情况下姐妹之间的亲缘鉴定。
【关键词】 法医物证学;X染色体;短串联重复序列;同胞亲缘鉴定
Abstract: Objective:To study the application of specific genetic pattern of X-chromosome STR loci in siblings’ identification. Methods: 22 STR loci of whole blood of suspicious one and three siblings were examined with polymerase chain reaction (PCR), PAGE and silver staining technique, and the hypervariable region of the mitochondrial D-loop were sequenced. Results: Two X-chromosome STR loci(DXS7132、DXS6804)and Four autosomal STR loci(D1S549, D2S441, 4D16S539 and D5S818)have been found, which can be used to exclude the suspicion in siblings’ identification. Conclusion: X-chromosome STR loci exist in the male genome in the form of haploid, which is especially useful for forensic science application, such as the siblings’ identification in the absence of parents.
Key words: forensic biological evidence; X chromosome; short tandem repeats; siblings’ identification
X染色体短串联重复序列(short tandem repeats, STR)广泛分布于真核基因组中,高度稳定且具有高度多态性,在男性的基因组中呈单倍型形式存在,遗传方式独特--父亲的等位基因只能遗传给女儿,所以它具有一些常染色体遗传标记无法比拟的优点,特别适用于法医学实践中在父母缺如情况下姐妹之间的亲缘鉴定,这种独特的遗传方式已引起了一些法医工作者的注意[1,2]。
1 材料和方法
1.1 同胞关系鉴定的案例 由律师事务所委托,对一位未知女性个体与3位已知同胞兄妹之间是否存在同胞亲缘关系进行鉴定。
1.2 样本 每位当事人采静脉血0.5 ml,用5% EDTA抗凝,于-20 ℃冰箱冻存。
1.3 STR基因座的检测 取未知个体(1号)和三名同胞兄妹(2、3、4号)的血样,采用Chelex-100快速法[3]提取基因组DNA后进行扩增:94 ℃预变性3 min,94 ℃ 50 s,58 ℃ 40 s,72 ℃ 40 s,34个循环,72 ℃末次延伸10 min,4 ℃保存。检测位点包括DXS7132、DXS6804、DXS6799等3个X染色体STR基因座和D6S477 、D1S549、D3S1754、D12S391、D12S375、D18S865、D18S535、D7S2846、D16S539、D3S1358、D8S1179、CSFIPO、VWA、D5S818、D19S400、D18S1364、D13S317、D2S441、D20S85等19个STR基因座。扩增产物经6%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分离,银染显示电泳谱带,用标准等位基因Ladder确定其基因型。
1.4 线粒体D环高变区DNA序列测定 将1号与2号的线粒体D环高变区DNA经PCR扩增和产物纯化后,委托上海Sangon用双脱氧终止法在ABI公司的3
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