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弓形虫三磷酸核苷水解酶基因克隆及序列分析
弓形虫三磷酸核苷水解酶基因克隆及序列分析
【摘要】 目的:克隆并分析我国刚地弓形虫三磷酸核苷水解酶(NTPase)的编码基因。方法:采用聚合酶链反应(PCR)扩增弓形虫RH株的NTPase基因,克隆入pGEM-T Easy载体,转化后挑取阳性克隆进行酶切与测序鉴定,并对获得的NTPase基因及推导的氨基酸序列进行生物信息学分析。结果:PCR扩增得到特异的弓形虫NTPase基因序列,测序结果表明,获得的弓形虫NTPase-Ⅱ基因全长1 812 bp,编码的603个氨基酸与Genebank报道的氨基酸序列同源性为100%。经DNAStar预测NTPase-Ⅱ存在6个潜在抗原表位。结论:成功克隆出序列正确的弓形虫NTPase-Ⅱ基因,为其相关研究奠定了基础。
【关键词】 弓形虫 核苷水解酶 克隆 序列分析
Abstract: Objective:To clone and analyze the nucleoside triphosphate hydrolase (NTPase) gene of Toxoplasma gondii. Methods: The NTPase gene was amplified by polymerase chain reaction (PCR) from RH strain of Toxoplasma gondii and cloned into pGEM-T Easy vector. Positive clones were screened and identified by BglⅡ、HindⅢ digestion and sequenced. The DNA sequence and its deduced protein sequence were analyzed. Results: The NTPase gene was specifically amplified, DNA sequence analysis showed that the length of cloned gene was 1 812 base pair. The homology of this deduced amino acids sequence was 100% to that in the Genebank. Conclusion: The NTPase-Ⅱ gene is successfully cloned, providing basis for the future research about this gene.
Key words: Toxoplasma gondii; NTPase; cloning; sequencing
刚地弓形虫(Toxoplasma gondii)是专性细胞内寄生的机会致病性原虫,呈世界性分布。三磷酸核苷水解酶(nucleoside triphosphate hydrolase,NTPase)为分布于弓形虫速殖子表面一种主要特异性抗原[1,2],其对虫体在宿主细胞内的寄生和繁殖都具有重要的作用[3]。目前,国内关于弓形虫病诊断和疫苗候选抗原的研究主要集中在P30(SAG1)和P22抗原[4-6],而对NTPase的研究鲜见报道。因此,我们对弓形虫RH株的NTPase基因进行扩增与克隆,为下一步的研究奠定基础。
1 材料和方法
1.1 虫株和试剂 弓形虫RH株由浙江省医学科学研究院寄生虫病研究所惠赠;E.coli DH5α为本室保存;pGEM-T Easy载体购自Promega公司。淋巴细胞分离液购自Sigma公司;限制性内切酶BglⅡ、HindⅢ和基因组DNA提取试剂盒均为大连宝生物产品;2×PCR Master Mix试剂盒购自上海晶美生物技术有限公司;小量质粒抽提试剂盒购自宁波中鼎生物技术公司;200 bp Marker及DNA凝胶回收试剂盒为上海生物工程技术有限公司产品。
1.2 模板DNA制备 弓形虫RH株速殖子连续在小鼠体内传代,感染3 d后无菌操作抽取腹水,虫体用生理盐水洗涤3次,加入与虫体混悬液等量的淋巴细胞分离液,800 r/min离心8 min后加速至2 000 r/min离心10 min,收集中层虫体[7],按DNA提取试剂盒说明书抽提弓形虫基因组DNA,用分光光度法测定DNA的浓度和纯度。
1.3 PCR扩增 根据弓形虫NTPase参考核苷酸序列[8]和表达载体克隆位点内切酶图谱分析结果,采用Primer Designer引物设计软件自行设计引物,由上海基康生物技术公司合成,引物序列如下:上游引物:5’-GAAGATCTACAGACTCATCGTCACT CCG-3’(下划线为BglⅡ酶切位点),下游引物:5’-GCAAGC
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