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基于肺部CT的肿瘤形态与纹理的三维变化检测.doc
基于肺部CT的肿瘤形态与纹理的三维变化检测
熊婷,黄绍辉(,黄晓阳,王连生,王博亮
(厦门大学信息科学与技术学院,福建 厦门 361005)
摘要:提取四个阶段肺部肿瘤CT图像的肿瘤区域,然后进行三维重建,计算三维肿瘤的形态特征参数和纹理特征参数,研究这两部分参数与肿瘤的变化关系。基于体素和Quick Hull算法计算出肿瘤的形态特征参数,结合灰度共生矩阵计算出四个阶段三维肿瘤的纹理特征参数,组成判别肿瘤三维变化的特征参数组合。实验结果证明,形态特征参数可以判断肿瘤的体积大小变化,纹理特征参数可以判断肿瘤内部活性变化。肺部肿瘤在治疗阶段体积大小发生了先变小后变大的变化,肿瘤纹理均匀性和粗细程度也发生了变化,在阶段Ⅲ体积和最长径的值最小,共生矩阵的能量、熵值和逆差分矩最大,这说明肿瘤最小且内部发生了坏死,这与临床结论相一致,为进一步指导肿瘤疗效评估奠定了基础。
关键词:肺部肿瘤;CT图像;Quick Hull;纹理特征;灰度共生矩阵
中图分类号:TP 391 文献标识码: A
肺部肿瘤是如今世界上最常见的内脏恶性肿瘤之一,对人群健康和生命造成了极大的威胁。根据世界卫生组织的报告[1],在2002年就有超过120万人死于肺癌,而且发病率还在呈抛物线式上升。因此,对肺癌的诊断效果和如何防治已经引发了世界医学界的极大关注[2]。而随着现代医学影像技术的飞速发展,目前临床检查主要利用了医学影像设备,比如CT。CT检查可以给我们提供各个部位的断层扫描图像,给医生诊断提供了直观的病变信息。
肿瘤疗效评价是决定病人继续治疗与否的依据[3],现在采用的实体瘤疗效评价标准多为RECIST标准,即基于CT影像测出肿瘤的最大径,根据最大径判断肿瘤大小的变化。但实际上,CT影像提供的不仅仅只是肿瘤大小的变化,还可以根据各个部位的CT值判断出灰度变化和纹理变化。事实证明,除了大小变化,纹理特征在一定程度上也能反映肿瘤的变化,这对于肿瘤疗效评估也是有效的。
纹理是自然界所有物体表面的一种基本的属性,可以作为描述和识别物体的重要特征。纹理特征研究的应用十分广泛,可以应用于工业自动化领域、远程传感、医疗诊断等。就医疗这一领域来说,基于CT影像的纹理特征主要被用来分类。譬如陈秋霞等人曾基于灰度共生矩阵计算出11个乳腺肿瘤超声影像的纹理特征参数,来对肿瘤进行良性恶性的判别[4]。马长东等人曾将纹理特征分析应用在基于PET/CT图像分析的肿瘤治疗效果研究当中,获取肿瘤的共生矩阵特征参数,尝试从纹理特征这一方面对治疗结果作出预测[5]。但是这些研究都是基于二维层面的CT影像,而事实上,三维所能表现的信息更多也更全面。
本文基于肿瘤的三维形态分析和三维纹理分析,对同一病人不同时期的四组肿瘤平扫CT影像数据的变化进行分析,提出一个三维肿瘤变化检测系统,为临床医生更好的对肿瘤疗效进行评估提供帮助。首先引用了肿瘤疗效评价的RECIST标准定义,将肿瘤最长径的测量扩展到三维层面,利用Quick Hull算法算出肿瘤三维形态的最长径,并基于体素计算出肿瘤的体积,将这两组数据作为形态分析的参数。为了更进一步分析三维肿瘤的变化,本文还增加了三维纹理特征参数,将每组CT影像三维重建,分割出肿瘤部分,对其进行纹理分析。传统的应用于医学影像的纹理分析方法主要是灰度共生矩阵[6-7],所以本文考虑将CT影像和灰度共生矩阵相结合,计算出纹理特征对三维肿瘤进行分析。图1是三维肿瘤变化检测流程图,下文将按照2个模块来介绍。
图 1三维肿瘤变化检测流程图
Fig.1 flow chart of 3D tumor change detection
基于体素和Quick Hull算法的三维肿瘤形态分析
实验数据介绍
本文的实验数据来自厦门某医院同一病人四个时期的平扫CT影像,阶段Ⅰ的CT采集时间为2013年7月4日,阶段Ⅱ时间为2013年9月25日,阶段Ⅲ时间为2013年10月15日,阶段Ⅳ时间为2013年12月3日。每个阶段的样本的大小均为512×512,CT值从-1024 Hu到3071Hu共4096个级别,分割后的肿瘤CT值在0-255Hu区间。
Quick Hull算法介绍
本文在计算肿瘤的三维最长径中采用三维凸包算法中的Quick Hull算法[8],先初始化一个四面体,然后在每轮迭代处理中,将三维点集中的任意一点p加入到当前凸包中去进行判断是否在凸包外,如果是则生成新的三角面,从而得到最终的凸包。
设三维空间i的集合为P,我们i中(x,y,z)三个中的某个坐标轴的最大值或者是最小值的四个点作为集合,并用这四个点组成一个初始化的四面体。初始化一个空的面集合V,并将这四面体的四个面都加入集合V,并更新点集合P=P-。接下来每次选用整个凸包的极值点来构建新的凸包。
将每个点的外部面集记成,同
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