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生物化学 第三章 核酸化学
第三章 核酸化学 第一节 概述 第二节 核酸的化学组成 第三节 DNA的结构 第四节 RNA的结构 第五节 核酸及核苷酸的性质 第六节 核酸的分离提取和纯化 第一节 概述 二、核酸的种类、分布和功能 1、脱氧核糖核酸(DNA,Deoxyribonucleic Acid) 5′磷酸核苷酸的基本结构 一、核酸完全水解的产物 核苷酸的结构和命名 常见(脱氧)核苷酸的结构和命名 碱基、核苷、核苷酸的概念和关系 三、稀有组分 腺苷酸及其多磷酸化合物 体内重要的环化核苷酸有3′,5′-环化腺苷酸(cAMP)和3′,5′-环化鸟苷酸(cGMP)。 是重要的调节物质,被称为第二信使。 NAD、NADP、FAD、HSCoA 医疗中,ATP作为能源药物用于心力衰竭急救,cAMP用于心肌梗死,阿拉伯糖胞苷有抗DNA病毒作用,用于抗癌。 在食品发酵中,5′-肌苷酸和5′-鸟苷酸有助鲜作用,强力味精。 天然存在的茶叶碱、可可碱及咖啡碱都是黄嘌呤的甲基衍生物,具有增强心脏活动的功能。 第三节 DNA的分子结构 一、DNA的一级结构 DNA一级结构的表示法 (三)DNA的双螺旋结构稳定因素 三种DNA双螺旋构象比较 三、DNA的三级结构 四、染色体结构 DNA存在形式 真核生物染色体DNA组装不同层次的结构 第四节 RNA的分子结构 一、RNA的一级结构 DNA、RNA的一级结构 原核生物mRNA的结构 真核生物mRNA的结构 帽子的功能: (1)可抵抗5′-核酸外切酶降解mRNA; (2)在蛋白质合成中,有助于核糖体对mRNA的认别和结合,使翻译得以正确起始。 Poly(A)功能 : (1)与mRNA从细胞核到细胞质的运输有关; (2)提高mRNA在胞质中的稳定性,延长mRNA的寿命。 转运RNA (tRNA) tRNA的功能(主要): 在蛋白质合成过程中,转运氨基酸和识别密码子。 酵母tRNA Ala 的二级结构 氨基酸臂:7对碱基组成,3′末端为CCA-OH,-OH 端结合活化的氨基酸。 二氢尿嘧啶环(DHU环):由8~12个核苷酸,含有二氢尿嘧啶(D)而得名。 反密码环:一般由7~9个核苷酸组成,含反密码子,反密码子与mRNA上的密码子配对,将合适的氨基酸携带到合适的位置。 额外环:位于反密码区与T?C区之间,不同的tRNA该区变化较大。 T?C环:含有胸苷(T)、假尿苷(?) 和胞苷(C),故名T?C。 tRNA的三级结构 第五节 核酸及核苷酸的性质 一、一般物理性质 二、紫外吸收性质 三、核酸和核苷酸的两性解离 四、核酸的变性、复性和分子杂交 五、核酸的显色反应 一、一般物理性质 1. DNA白色絮状固体,RNA白色粉末状固体,都溶于水,不溶于乙醇,因此常用乙醇来沉淀; 2. DNA溶液黏度大于RNA溶液; 3. DNA难溶于0.14mol/L的NaCl溶液,可溶于1~2 mol/L的NaCl溶液,RNA则相反,可据此分离二者。 二、紫外吸收 嘌呤碱和嘧啶碱都含有共轭双键体系,所以核苷、核苷酸、DNA、RNA在240~290 nm有吸收; 最大吸收峰为260nm,可用于核酸的定性和定量测定; 不同碱基的紫外吸收特性不同。 三、两性解离 核酸和核苷酸含酸性的磷酸基团,又含弱碱性的碱基,为两性电解质,可发生两性解离; 等电点偏酸性,DNA的pI约为4~5,RNA的pI约为2.0~2.5,在pH7~8电泳时泳向正极; 尿嘧啶和胸腺嘧啶不能进行碱性解离; 利用两性解离特性和等电点,可以来分离、纯化、制备核酸。 DNA的变性过程 Tm:熔解温度(melting temperature) (三)分子杂交(hybridization) 来源不同的DNA,若彼此间有部分互补的核苷酸顺序,在同一溶液中进行热变性和退火处理后,形成新的杂种双螺旋,这一现象称为核酸的分子杂交。 分子杂交的原理示意图 核酸的变性、复性和杂交 Southern印迹法 分子杂交的种类 Southern Blot:DNA-DNA杂交 Northern Blot:DNA-RNA杂交 Western Blot:抗原-抗体进行杂交 五、核酸的显色反应 1.核糖的地衣酚( 甲基间苯二酚)反应 核酸的显色反应 3. 核酸中磷酸的定量检测 钼蓝反应 二、核酸的纯化 1.超速离心 溴化乙淀-氯化铯密度梯度离心 2.凝胶电泳 琼脂糖凝胶电泳 聚丙烯酰胺凝胶电泳 3.柱层析 1. 试比较核酸、蛋白质一级结构的异同,写出各自基本结构单位的通式 。 腺嘌呤 鸟嘌呤 胞嘧啶 胸腺嘧啶 尿嘧啶 根据A260/A280的比值判断核酸样品的纯度 纯DNA:A260/A280=1.8 纯
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