南极菲尔德斯半岛表层土壤样品中细菌多样性地系统发育分析.PDFVIP

第 17 卷第 4 期 极地研究 Vol . 17 , No . 4 2005 年 12 月 C H IN ESE J OU RN AL O F POL A R R ESEA RC H December 2005 研究论文 南极菲尔德斯半岛表层土壤样品中 细菌多样性的系统发育分析 1 ,2 1 1 2 2 1 李会荣 　孙嘉康 　陈丽珊 　俞勇 　陈波 　任大明 ( 1 复旦大学遗传学研究所遗传工程国家重点实验室 , 上海 200433 ; 2 中国极地研究中心国家海洋局极地科学重点实验室 , 上海 200 136) ( ) 提要 　通过 PCR 结合变性梯度凝胶电泳 D GGE 技术对从南极长城站附近表层土壤样品中获 得 16 S rDN A 序列特征片段 V3 区序列进行分离 。对其中的主要 12 条 D GGE 条带进行胶回收 , βγδ ( 获得的DN A 片段经测序以及计算机比对分析发现 ,它们分别属于 、、变形细菌 Prot eobac ) ( ) t eria 、噬纤维菌屈挠杆菌拟杆菌 Cy top hag aF lex ibacte rB acteroi des , CFB 群细菌 、放线细 ( ) ( ) ( ) ( 菌 Actinobact eria 、蓝细菌属 Cy anobacte ri a 、酸杆菌属 A ci dobacteri a 和绿屈挠菌属 Chlo rof lex i) 等系统分类群 。南极表层土壤样品中的大部分 16 S rDN A 序列与从其他土壤或沉积物 ( ) 样品中直接获得的序列相似性较高 93 % —100 % 。 关键词 　南极 　表层土壤 　细菌 　D GGE 　16 S rDN A 　　南极地区的土壤是在地球上最恶劣的条件下形成的。由于恶劣的气候条件 ,大部分 ( 土壤是在小凹坑或岩石的掩蔽下经风化作用或稀少有机物的微生物活动而形成的 N e goit a et al . , 200 1) 。这样形成的土壤仅 占南极大陆永冻土区域的 2 —3 % 。在这个地区 只有少数的土壤类型被描述 , 这些处于原始阶段的土壤被简单地概括为亚南极大陆褐土 ( subA nt arctic brow n soil s) ( Blt er et al . , 1997) 。 在南极地区 ,条件是如此的恶劣以致几乎没有大型植物生长 ,土壤成了微生物占绝对 ( ) ( ) 优势的生态系统 Beyer et al . , 1999 。Cowan 等 2002 采用生物发光 A TP 检测方法对 南极 Dry V alley 的矿土中微生物进行计数 ,发现粉状表层矿土中的细菌数比预计的要高 出4 个数量级 。一直以来 ,关于南极土壤微生物的研究仅限于采用培养方法进行计数或 (