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PCR引物设计及软件使用技巧推广
生 物 信 息 学 China Journal of Bioinformatics 研究论文
PCR 引物设计及软件使用技巧
张新宇 ,高燕宁
( 中国协和医科大学中国医学科学院肿瘤研究所 ,北京 100021)
摘要 :介绍了使用软件设计 PCR 引物的技巧 。在 PCR 引物设计原则的基础上 ,详细介绍了两种常用引物设计软件的基本使用
方法 ,并对其各自的优缺点进行了比较 。一般性引物自动搜索可采用“Premier Primer 5 ”软件 ,而引物的评价分析则可采用“Oli
go6 ”软件 。
关键词 :PCR ;引物设计 ;软件
( )
中图分类号 :Q524 文献标识码 :B 文章编号 :1672 - 5565 2004 - 04 - 0015 - 04
To design PCR primers with Oligo 6 and Primer Premier 5
ZHANG Xin - yu ,GAO Yan - ning
( )
Cancer Institute , Chinese Academy of Medical Sciences , Beijing , 100021 , China
Abstract :The skill of PCR primer design with software is introduced in this paper. Based on the principle of PCR -
primer design ,the usage of two kinds of popular primer - design software was reviewed detailedly ,including their merit ,
demerit and usage skills. It is recommended to use Premier Primer 5 for the usual automatic primers search ,but Oligo 6
primers analysis.
Key words :PCR primer ;design ;usage skill ;software
自从 1985 年 KarnyMullis 发明了聚合酶链式反应 具体实现这 3 条基本原则需要考虑到诸多因
( ) ( ) (
PCR 以来 ,PCR 技术已成为分子生物学研究中使用 素 ,如 引物长度 primer length , 产物长度 product
[1] ) ( )
最多、最广泛的手段之一 ,而引物设计是 PCR 技术 length ,序列 Tm 值 melting temperature , 引物与模板
( Δ
中至关重要的一环 。使用不合适的 PCR 引物容易导
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