郜刚分子生物学07生物信息的传递2真核启动子转录过程.ppt

第03章 生物信息的传递（上） ——从DNA到RNA CAP位点 这是一个调控位点，即环腺苷酸受体蛋白位点。但这个位点并不是所有的启动子都有的。 以大肠杆菌乳糖启动子为例，CAP位点有两个，一个位于－70到－50，另一个位于－50到－40。至于这两个CAP位点是起什么作用的，以后我们在基因表达调控中再详细地讲述。 上面主要讲述了原核生物操纵元的主要序列启动子，因为它与转录关系十分密切，所以应该有一个比较详细的介绍，另外的几个序列比如调节基因、结构基因将在以后的各章节中逐个介绍。 3.3.1 真核生物启动子结构 真核有三种不同的启动子和有关的元件 分别的对应三种不同的RNA聚合酶，不同的酶分别识别不同的启动子，因为它们具有不同的结构 启动子Ⅱ最为复杂，它和原核的启动子有很多不同 3.3.1.1真核生物RNA聚合酶II的启动子 真核生物启动子的结构 （1）、核心启动子 ●定义：指保证RNA聚合酶Ⅱ转录正常起始所必需的、最少的DNA序列，包括转录起始位点及转录起始位点上游TATA区 （2）、上游启动子元件page80 ●包括CAAT盒（CCAAT）和GC盒（GGGCGG）等 3.3.1.2 真核生物RNA聚合酶I 的启动子 3.3.1.3 RNA聚合酶III的启动子 III转录tRNA、5S RNA、部分snRNA，但是却有不同的启动子。其中snRNA使用与其他启动子结构相同的上游启动子，但是tRNA、5S RNA却使用一种“内部启动子”，也就是说启动子位于基因内部。 可以分为两类： 总结真核生物RNA聚合酶启动子结构的复杂性 三种不同的RNA聚合酶有不同的启动子，其中启动子Ⅱ最为复杂，它和原核的启动子有很多不同：（1）有多种元件：TATA框，GC框，CATT框，OCT等；（2）结构不恒定。有的有多种框盒如组蛋白H2B；有的只有TATA框和GC框，如SV40早期转录蛋白，（3）它们的位置、序列、距离和方向都不完全相同，（4）有的有远距离的调控元件存在，如增强子；（5）这些元件常常起到控制转录效率和选择起始位点的作用；（6）不直接和RNA pol结合。转录时先和其它转录激活因子相结合，再和聚合酶结合。 SV40 早期启动子page81 组蛋白H2B 增强子enhancer page78 1、增强子的定义 增强子是真核生物中通过启动子来增强转录的一种远端遗传性顺式作用元件，有效的增强子可以位于5’、3’、甚至基因内部的内含子中，一般长度为100－200bp，其基本核心元件常由8－12bp组成，常形成回文序列，并以单拷贝或者多拷贝的串联形式存在。 增强子的特性page79 远距离效应：可以在远距离作用（1000－4000bp） 无方向性：没有5’、3’的固定的方向性 顺式调节：通过启动子增强同一DNA链上靶基因的转录速率； 无物种和基因的特异性：对同源或者异源基因同样有效 具有细胞特异性或者组织特异性 位置多样 有相位性：增强子的活性与其在DNA双螺旋结构中 的空间方向性有关 与外部信号有关 增强子的一种作用方式（了解） 组织细胞专一性增强子 诱导性增强子 减弱子（dehancer了解） 在某些基因的上游远端或下游远端具有负调节序列，其作用不受距离和方向的影响，叫做减弱子。如C-mos基因上游0.8或1.8Kb处有一序列，使C-mos不易被反转录病毒的长末端重复序列（LTR）所激活。在C-myc基因的3′端也存在着减弱子 静息子（silencer了解） 在酵母交配型转换的盒式模型中，左右两个沉默框（HML和HMR）都不表达，此是由于在这两个框盒上游1.5Kb处都有一个E片段，它可和阻遏沉默框盒表达的蛋白SIR（1-4）（silent mating tyne information regulation）结合，起抑制转录作用，故称静息子，可作用2.5Kb远的启动子。 上游激活序列（upstream activating seguences UASs） UASs是酵母中远上游序列类似于增强子。它仅影响转录程度，对位点选择不起作用。和增强子不同的是它有方向性，不能在启动子的下游起作用。它结合的转录因子是GCN4和GAL4，识别位点为ATGACTCAT。 Page 73 3.2.2转录的过程 转录复合物 （1）模板识别：形成转录起始前复合物 原核生物转录起始前复合物page67 由于RNA聚合酶是一个分子很大的酶，与-35序列结合并不是很牢固，而是在其附近进行滑动，滑动的结果是RNA聚合酶β’亚基与富含AT的-10序列相结合，并且使得RNA聚合酶牢固的结合在该部位，然后-10序列以及起始点处的DNA发生局部解链，长度在12bp～17bp，这时候就形成所谓的开放式启动