MS中CASTEP模块进行DFT计算`.pdfVIP

几天在学习用Material studio 软件包中CASTEP 模块进行DFT 计算，找到一个CASTEP 模块的详细说明， 不敢独享！ CASTEP 前言 CASTEP 模組提供了一個完整且容易使用的介面來操作CASTEP/CETEP 計算物理與化學程式,這一個介面允許 你使用Cerius2 Visualizer所提供的交談式圖形介面與模擬環境來有效的發揮CASTEP 的量子力學功能 註解 雖然CASTEP 主要是用於大尺度的週期性系統，他 可以被應用在以超晶格建力起來的缺陷表面介面與分 子，更進一步的資訊請參照42 頁的”非週期系統”已獲的更進一步的資訊。 CASTEP 模組允許你使用含有彈性的分子模型工具，Cerius2 模型環境所提供的進階的GUI 來產生與設定模 型以便研究，定義你要進行計算工作的形式，並且在本地端的機器或遠端的機器執行它。 你的CASTEP run 一跑完，你就可以使用CASTEP 模組的分析工具來抽取及檢視由CASTEP 所產生的原始輸出 資料。這原始輸出結果藉由大量的數據來描述你模型的性質。 動態使用介面 雖然機制羯大部份是明顯的，Cerius2 透過由使用者介面建立的好幾個CASTEP 輸出輸入的資料檔來與 CASTEP 產生聯繫。你所要執行的job 上設定的選項會被用來產生一個檔案， 檔案會被傳送到CASTEP 做 為輸入。 如果CASTEP 完全執行成功，結果會被寫入輸出檔案，CASTEP 模組分析工具會去讀取這些檔案，由原始的 資料輸出，抽取並整理出更加容易讀的資訊。 CASTEP 理論 這個CASTEP 套件是具有模擬金屬，絕緣體或半導體的電子鬆弛到基態的能力。使用這個技術，CASTEP 可 以計算作用在原子的受力和單位晶格上的應力。原子上來的受力己經被用來找出平衡的結構或進行模擬分 子動力學(使用正則系綜或微正則系綜) 。 前言 CASTEP 的理論基礎是電荷密度泛函理論在局域電荷密度近似或是梯度修正的版本，這是由Perdew 和 Wang 所發展的GGA。DFT 所描述的電子氣體交互作用被認為是對大部分的狀況都是夠精確的，並且他是唯一能實 際有效分析週期性系統的理論方法。請看第三章一般理論來或的更進一步的DFT 理論。 在CASTEP 裡預設的設定是GGA，它在很多狀況下被知道是比較好的方法。梯度修正的方法在研究表面的過 程、小分子的性質、氫鍵晶體以及有內部空間的晶體 （費時）是比較精確的。眾所皆知，LDA 會低估分子 的鍵長 （or 鍵能）以及晶體的晶格參數，而GGA 通常會補救這缺點。然而，有許多證據顯示GGA 會在離子 晶體過度修正LDA 結果；當LDA 與實驗符合得非常好的時候，GGA 會高估晶格長度。因 要推薦一個對所 有系統都是最好的特定方法是很困難的。 膺勢 電子-離子間的交互作用可以用膺勢的觀念來描述。對於每種元素而言,CASTEP 提供了一套的的位勢： 位 勢 延 伸 檔 名 ultrasoft .usp norm-conserving potential 使用Lin et al.最佳化方法來產生 .recpot norm-conserving potential 使用Troullier-Martins 最佳化方法來產生 .pspnc 未最佳化硬的norm-conserving potential 使用Teter 方法來產生 .psp Norm-conserving 位勢這個方法理論是相當有名的而且是經徹底驗證的。在這樣的方法之中，pseudo 波函 數在定義的核心區域的截止半徑以上是符合all –electron 波函數的。在截止半徑之內，pseudo 波函數 沒有結點，且和norm-conserving 條件之 all - electron 波函數連結在一起：也就是說他們的帶著相同 的電荷。在使相當高截止能量代價之下這些膺勢可以相當高的精準度被做出來。Teter 位勢便是具有如 的特性但是這個相當硬的膺勢。最佳化的方法，特別是林等人的方法，允許軟的norm-conserving 位勢的 產生，然而描述第一列 （碳，氮，氧）或過渡金屬（鎳，銅，鈀）等局域化價電子軌域的所需之截止能量 仍然經常還是太高。 Vanderbilt 所提出來的超軟膺勢的想法是不用釋放非收斂性條件用這樣的方法來產生更軟的位勢。在這各 方法裡頭虛波函數在核心範圍是被允許作成盡可能 軟，以致於截止能量可以被大大的減小。技術上而言 這是靠著廣義的正交條件來達成的。為了要重建整個總的電子密度，波函數平方所得到電荷密度必須在核 心範圍在加以附加額外得密度進去。這個電子雲密度因 就被分成