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微生物资源的收集和保藏 张道锋 上海交通大学 农业与生物学院 食品安全与微生物实验室 2015.1 内容提要 1.微生物资源分布 2.样品收集和处理 3.预处理和选择性培养基 4.获得纯培养和初步鉴定 5.新物种的识别和鉴定 6.菌种保藏和编号 7.相关机构和网站 8.系统分类学简介 微生物资源分布 普通环境, 不详, 5, 3% 33, 21% 动物, 27, 18% 植物, 5, 3% 分枝杆菌160多个物种的来源分布 临床样本, 85, 55% 矿地水池, 有机污染土壤, 排泄物, 4, 3% 1, 1% 5, 3% 其他, 7, 5% 河流, 5, 3% 伤口感染, 土壤, 20, 13% 6, 4% 组织, 31, 21% 尘埃, 2, 1% 牛, 5, 3% 鱼, 8, 5% 组织洗液, 9, 猴, 2, 1% 6% 痰, 28, 19% 水苔, 其他, 12, 8% 5, 3% 样品收集和运输 原则：避免外源污染；避免长途运输 造成目标群体的消亡 样品 样品 运输 收集 预处理和选择性培养基 • 分离目的：定向分离，分离未知菌，分离“混合菌” • 基本原则：获得目的菌，排除非目的菌 • 预处理：富集，减少非目的菌，促进萌发，促进释放； 干热，湿热，增菌，噬菌体，表面活性剂，机械破碎，震 荡均质…… • 选择性培养基：针对分离目的选择，pH，盐浓度，特殊 营养物质，抑制剂 • 其他因素：氧气、温度、培养时间 获得纯培养和初步鉴定 • 纯