我国一株新型黄头病毒的分子流行病学.pdfVIP

第37 卷 第3 期 渔 业 科 学 进 展 Vol.37, No.3 2 0 1 6 年 6 月 PROGRESS IN FISHERY SCIENCES Jun., 2016 DOI: 10.11758/yykxjz.20150430001 / 我国一株新型黄头病毒的分子流行病学* 1,2 1,3 1 1,2 朱罗罗 张庆利 万晓媛 邱 亮 马 芳1,2 黄 倢1,2,3① (1. 农业部海洋渔业可持续发展重点实验室 中国水产科学研究院黄海水产研究所 青岛 266071 ； 2. 上海海洋大学 上海 201306 ；3. 青岛海洋科学与技术国家实验室 海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室 青岛 266071) 摘要 为查明黄头病毒(Yellow Head Virus, YHV)在我国的存在和变异情况，本研究采用世界动物 卫生组织(OIE) 《水生动物诊断手册》中YHV 套式RT-PCR 检测方法对2012–2014 年采集的299 份 样品进行了YHV 监测，并对部分YHV 阳性样品基因进行了克隆测序及系统发育分析。流行病学 调查显示，299 份样品中YHV 的阳性率为11%，我国养殖的中国明对虾、凡纳滨对虾、日本囊对 虾以及罗氏沼虾的部分样品中均检出了YHV ，中国明对虾和罗氏沼虾是本次调查中新发现的YHV 自然宿主，而且YHV 在中国明对虾中的检出率最高。对6 份较强阳性样品YHV 基因组ORF1b 内 1002 bp 的分型片段进行克隆测序和序列分析，序列比对结果显示，阳性样品的YHV 与国外报道 的YHV 的6 个基因型相似度为81.0%–90.5% ；系统发育分析显示，6 份阳性样品归于同一分支， 但与已知YHV 的6 个基因型均不在同一分支内，其与YHV 基因1 型(YHV-1)亲缘关系较近。对阳 性样品YHV 基因组ORF3 内编码gp116 蛋白的一段序列进行克隆测序，得出其序列长度为509 bp ， 与YHV-1a 的545 bp、YHV-1b 的383 bp 和YHV-2 ( 即鳃联病毒GAV) 的476 bp 均不同；依据该片 段构建的系统发育树显示，6 份阳性样品归于同一分支，与YHV 已知的6 个基因型不同，与YHV-1 亲缘关系较近，且与YHV-1a 相似度大于YHV-1b 。对其中两份样品的ORF2 序列进行比对显示， 两份样品序列相似性为99.8% ，蛋白序列完全相同，与YHV-1 的序列相似度为85.9% ，与YHV-2 相似性为80.9%。样品调查结果对增补YHV 的宿主范围有重要意义；YHV 核酸检测和序列比对结 果表明，感染我国养殖对虾的YHV 为一种新的致病株型。 关键词 黄头病毒；新基因型；系统发育树；对虾；流行病学 中图分类号 S945 文献标识码 A 文章编号 2095-9869(2016)03-0068-10 黄头病毒(Yellow Head Virus, YHV) 属于单链 2010 年起，越南、马来西亚、泰国和我国海南 RNA 病毒的套式病毒目、杆套病毒科、头甲病毒属 等地养殖的凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)相继 (Cowley et al, 2012)。黄头病毒群分为黄头病毒(YHV-1 出现不明原因的疫病，并导致较高的死亡率。目前， 型) 、鳃联病毒(Gill-associated virus, GAV)(YHV-2 型) 已经确定对虾早期死亡综合征能感染凡纳滨对虾、 及其他至少 4 种基因型(YHV-3 型–YHV-6 型) 斑节对虾 (Penaeus monodon) 、中国明对虾 (Wijegoonawardane et al, 2009) 。