遗传学（双语）徐吉臣-第18章.pdfVIP

Chapter 18 Genomics and proteomics 18.1 Linkage map 18.2 Transcriptional map 18.3 Physical map 18.4 Genome sequence map 18.5 Functional Genomics 18.6 Proteomics Genomics (基因组学): 以整个基因组为研究 单位,认识基因组的结构、功能和进化，了解 基因组包含的遗传物质的全部信息及相互关 系，为充分合理地利用各种有效资源提供科 学依据。 Characteristics of Genomics 1) Global：所有基因及其产物 （RNA和蛋白质） 2) High throughput：高通量分析技术 3) Dynamic动态 ：相互作用、代谢、生理等。 1）构建基因组的遗传图谱 （genetic map） 2）构建基因组的物理图谱 （physical map） 3）构建基因组DNA全序列 （DNA sequencing） 结构基因组学 4）构建基因组转录图 （Transcrptome） 5）功能基因组 (functional genomics) 6）比较基因组学 （comparative genomics) 7）代谢组 功能基因组学 8）生物信息学 （bioinformatics) （后基因组时代） ………… 18.1 遗传图谱的构建 遗传图谱：生物的遗传性状或标记的连锁图，并 定位到染色体上。了解基因或标记在染色体上的 位置、排列顺序、相互关系。 • 群体 • 标记 • 图谱绘制作图软件 Human linkage map • 21 three-generation families • 403 polymorphic loci • representing 23 human chromosomes • Linkage map is detectably linked to at least 95 of the DNA in the human genome. 18.2 转录图谱 DNA → RNA → Protein ↓ cDNA (EST) • 基因转录图指具有表达能力的cDNA图，即表达序列 标签图 (EST，expressed sequence tag)，包括转录 基因的染色体定位，基因转录的强度等信息 一、基因表达的时间性及空间性 • 时间特异性(time specificity) ：按功能需要，某 一特定基因的表达严格按特定的时间顺序发生。 • 空间特异性(spatial specificity) ：在个体生长 全过程，某种基因产物在个体按不同组织空间顺序 出现。 二、基因表达的方式 按对刺激的反应性，基因表达的方式分为： （一）组成性表达(constitutive gene expression) • 基因在个体的几乎所有细胞中持续表达，称为管家基 因(housekeeping gene)。 • 管家基因较少受环境因素影响，或变化很小。 （二）诱导和阻遏表达 • 在特定环境信号刺激下，相应的基因被激活，基因 表达产物增加，称为可诱导基因 （induced） • 在特定环境信号刺激下，相应的基因被抑制，基因 表达产物减少，称为可阻遏基因 (repression) 适应环境 维持个体发育与分化 18.3 构建基因组的物理图谱 显示基因、标记在各染色体上的明确物理位置。 • Constructing genomic library with larger fragment • Determinate the linka