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鱼藤素分子动力学模拟及其构效研究
鱼藤素分子动力学模拟及其构效研究
1,2 2 2 2 2 1,2 2 1
管永光 ,吴两相 ,朱龙峰 ,刘德光 ,陈文清 ,杨海花 ,林燕 ,庞杰 ,
甘纯玑2
1. 福建农林大学食品科学学院,福州(350002 )
2. 福建农林大学生物技术中心,福州(350002 )
E-mail:guan00078@163.com
摘 要:应用分子力学优化鱼藤素分子构象,经分子动力学、Semi-empirical方法模拟计算
鱼藤素分子不同外场下能量变化及电荷分布。模拟结果表明, 鱼藤素在超低温条件下可与水
分子形成氢键,室温下不易与水形成氢键。Semi-empirical理论CNDO方法预测结果显示,鱼
藤素C环上的羰基易发生亲核反应。
关键词:鱼藤素;分子动力学模拟;结构
1. 引言
鱼藤素(deguelin)是一种天然异黄酮类化合物,主要存在于豆科鱼藤属(Derris Lour )植
物根、茎部位以及灰叶属(Tephrosia Pers)植物叶中,其结构如图1所示[1~3] 。近年来研究
发现,鱼藤素具有显著抗肿瘤活性,对肺部肿瘤细胞的抑制尤为明显[4~6] 。鱼藤素分子结构
已被多种光谱方法(包括NMR 、IR 、UV) 研究测定[7~10],但对其构效关系、化学修饰等相关
研究却未见报道。
为了从理论上阐明鱼藤素分子的结构性质,本文应用HyperChem软件,运用分子动力学
(Molecular Dynamics, MD)、Semi-empirical理论CNDO方法,模拟计算鱼藤素分子在不同外
场条件下的构效关系以及电荷、电子云分布,预测鱼藤素在不同条件下的稳定构象及可能发
生的化学反应。
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