肿瘤研究及分子生物学数据库资源.ppt

肿瘤研究的分子生物学数据库资源;一篇论文的题目;主 要 内 容;NCBI的相关资源;Genes and disease;Genes and disease 页面;染色体的图谱;SKY—Spectral Karyotyping 多色标记的探针与染色体杂交 M-FISH—Multiplex Fluorescence In Situ Hybridization CGH—Comparative Genomic Hybridization 肿瘤和对照细胞的基因组DNA标记不同颜色荧光探针等量混合后分别与肿瘤和对照细胞的染色体杂交。 ;SKY的原理;CGH的原理;CGH比较工具 输入染色体片段和得失，如：7[gain]或3p[loss]. ;比较工具;比较结果;CGH图示;大规模分析基因表达的方法 对某一组mRNA中基因表达定量检测 一群mRNA中的每一个mRNA的同一位置取9-10bp的一段序列，（从统计学上说这样的序列可以代表95%的人类基因），每一种9-10bp的序列的拷贝数则代表基因表达的拷贝数，也就可以说明基因表达活性的高低。;方法 RNA反转录为cDNA，同时用生物素标记cDNA末端 随后用一种限制性内切酶（NlaIII (CATG)）切割cDNA分离酶切位点3‘端的序列 另一种酶再切割cDNA片段，去除带生物素的3’端 用PCR扩增每一个标签片段，将30-50个不同的标签