CD169基因及其蛋白性质和结构的生物信息学分析-中国农学通报.PDF

中国农学通报 2011,27(26):52-59 Chinese Agricultural Science Bulletin CD169基因及其蛋白性质和结构的生物信息学分析 周 傲，陈 星，张滢寅，张淑君 （华中农业大学农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室，武汉430070 ） 摘 要：对猪CD 169 基因编码蛋白的性质及结构等进行分析、预测，并与人、鼠、牛等物种CD 169 进行比 较分析。利用生物信息学相关分析软件和比较基因组学方法，对CD 169 基因序列和氨基酸序列进行氨 基酸组成、磷酸化、糖基化和结构特征等进行分析和预测。生物信息学分析结果表明，猪CD 169 含有磷 酸化和糖基化位点，具有信号肽结构和卷曲螺旋结构。该研究结果为深入研究CD 169 的受体功能、 PRRSV 感染的物种特异性或偏嗜性等提供有意的理论参考。 关键词：CD 169 ；信号肽；卷曲螺旋；生物信息学 中图分类号：S1 文献标志码：A 论文编号：2011-0501 BioformaticAnalysisofCD169GeneandItsProteinPropertyandStructure ZhouAo,ChenXing,ZhangYingyin,ZhangShujun (Key Lab of Agricultural Animal Genetics, Breeding and Reproduction of Ministry of Education, Huazhong Agricultural University,Wuhan430070) Abstract: Thisresearchaimedtoanalyzethestructureandcharactersof CD169 andtofindthespecial propertyofpig CD169 comparedtootheranimals. CD169 geneandproteinsequencewereanalyzedand predictedbyusingrelatedbioinformaticssoftwareandcomparativegenomicsmethods.Theresultsshowedthat therewasahighsimilarityof CD169 betweenswineandboss,andthatporcine CD169 mightcontainsignal peptide.Itwaspredictedtocontainphosphorylationsitesandglycosylationsites,holdingthecoiledcoil structure.TheresearchofCD169proteinwillbeveryhelpfultounderstandthefunctionofCD169asPRRSV receptor,andlayafoundationforstudyingthespecies-specificortropismforPRRSVinfection. Keywords:CD169;signalpeptide;coils;bioinformatics 0 引言 酸乙酰肝素（HS ）结合之后，只能使病毒粒子富集于细 CD 169 即唾液酸黏附素（Sialoadhesin，Sn），又叫 胞表面，不能介导病毒的感染，需要CD 169 蛋白的协 Siglec-1，是一种巨噬细胞特异性受体蛋白，由于它能 同，并在网格蛋白介导的内吞作用下才能引起病毒的 特异性地结合唾液酸部分，故又被称为凝集素受体，属 侵入。研究表明，猪CD 169 分子的唾液酸结合活性对 于 Ⅰ型凝集素。CD 169 分子可以作为受体调节蛋白 于PRRSV 的黏附至关