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miR-210在马氏珠母贝外套膜矿化机制中的结构和功能预测.pdfVIP

miR-210在马氏珠母贝外套膜矿化机制中的结构和功能预测.pdf

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第 36 卷 第 3 期 Vol.36 No.3 广东海洋大学学报 2016 年 6 月 Journal of Guangdong Ocean University Jun. 20 16 doi :10.3969/j.issn.1673-9159.2016.03.002 miR-210 在马氏珠母贝外套膜矿化机制中的结构和功能预测 潘晓艳,郑 哲,田荣荣,焦 钰,杜晓东 (广东海洋大学水产学院 ,广东 湛江 524025 ) 摘 要:为进一步探究 Pm-miR-210 在马氏珠母贝贝壳形成的作用 ,利用 miR-RACE 技术验证 Pm-miR-210 的成 熟体序列并进行序列分析 ,通过生物信息学分析来获得 Pm-miR-210 的前体序列 ,并进行组织定量和靶位点预测 。 结果表明 ,Pm-miR-210 的 miR-RACE 结果与高通量测序结果一致 ,利用转录组数据库与 Pm-miR-210 成熟 序 列比对 ,获得的前体序列长度为 80 bp 并具有典型的颈环结构 。多序列比对结果显示 ,Pm-miR-210 成熟体序列的 种子区域在不同物种间具有极高的保守性 。荧光定量结果得出 ,Pm-miR-210 在外套膜边缘膜和中央膜中均有表 达 ,但表达量差异不具统计学意义 (P 0.05 )。靶向预测分析结果显示 ,钙调蛋白 (calmodulin )、钙调磷酸酶-A 亚基 (calcineurin A subunit )、N19 以及 Shematrin-3 为 Pm-miR-210 的候选靶基因。 关键词:马氏珠母贝 ;Pm-miR-210 ;靶向预测 ;贝壳形成 中图分类号:S917.4 文献标志码:A 文章编号:1673-9159 (2016 )03-0009-06 The Structure and Function Prediction of miR-210 in the Mineralization Mechanism of Mantle in Pinctada martensii PAN Xiao-yan ,ZHENG Zhe ,TIAN Rong-rong ,JIAO Yu,DU Xiao-dong (Fisheries College ,Guangdong Ocean University ,Zhanjiang 524025 ,China )

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