华支睾吸虫多药物代谢产物外排蛋白样基因的识别和生物信息学分析.pdfVIP

中国人兽共患病学报 2008，24(2) 104 Chinese ofZoonoses Journal 文章编号：1002—2694(2008)02—0104—05 华支睾吸虫多药物／代谢产物外排蛋白样基因的识别 和生物信息学分析* 胡旭初，赵 宇，黄灿，刘 玲，余新炳，徐 劲 摘 要：目的 预测华支睾吸虫假想的多药物／代谢产物外排蛋白的结构及功能及其应用前景。方法 利用多种生物信 息学分析软件，从华支睾吸虫全长eDNA质粒支库中识别出多药物／代谢产物外排蛋白样基因，分析蛋白的拓扑学结构、生物 学和免疫学功能特征，根据结构与功能预测其应用前景。结果 该基因编码189个氨基酸；含有5段跨膜区，N端在胞内·C 端在胞外，具有主要协助因子超家族的结构特征。与Et本血吸虫同源蛋白(一致性为67％，相似性为80％)相比，该蛋白的4 段跨膜区中含有保守的精氨酸和组氨酸残基。该蛋白含有多个磷酸化位点和T、B细胞表位，且线性B细胞表位均位于胞外 区。结论 所克隆的华支睾吸虫基因可能编码一个小蛋白型阴离子多药物／代谢物外排蛋白；该蛋白可能定位于华支睾吸虫 皮层表膜，是一个潜在的诊断和疫苗候选抗原和药物靶标分子。 关键词：华支睾吸虫；小蛋白型多药物／代谢物外排蛋白；耐药性；诊断；疫苗 文献标识码：A 中图分类号：R383．2 ofClonorchissinensis andbioinformaties Reeognization analysis small efflux multidrug／metabolitesprotein—likegene HUXu—chu，ZHAOYu，HUANGCan，LIU Ling，YUXin—bing，XUJing SchoolMedicine，SunYat—sen ofParasitology。Zhongshanof University， (Department DiseaseControlandPreventionthe 510080，China) Education。Guangzhou KeyLaboratoryforTropical of Ministryof clonefromClonorchissinensis eDNA was asa smallmulti— ABSTRACT：A full—lengthplasmidlibraryrecognizedputative thestructuralaadfunctionalcharacteristicsofthe were efflux gene，and putativeproteinanalyzed drug／metabolitesprotein-like on-linebioinformaticstools by providedby CBS Vec