双亲本杂交衍生的多个相关群体 QTL 图的联合构建方法.PDFVIP

麦类作物学报 　2009 ,29 (4) :553558 J ournal of Triticeae Crop s 双亲本杂交衍生的多个相关群体 QTL 图的联合构建方法 敖 雁 ,胡治球 ,汤在祥 ,王学枫 ,徐辰武 (扬州大学江苏省作物遗传生理重点实验室 , 江苏扬州 225009) 摘 　要 : 为了研究双亲杂交衍生的多个群体 Q TL 作图分析的方法 ,对两个亲本通过任意杂交设计衍生的任 意多个相关群体联合分析的方法进行了探讨 。其要点是 :首先利用染色体上所有标记基因型联合计算该染色体上 任一假定位置 Q TL 的条件概率 ,然后根据混合分布理论建立基于 EM 算法实现的 Q TL 作图的极大似然估计方 法 。以双亲杂交衍生的 F2 和 BC 群体联合分析为例 ,用计算机模拟数据研究了 Q TL 遗传力和样本容量两个因素 对方法的影响 。结果表明 ,在染色体水平模拟时 ,相同的遗传力下 ,F2 和 BC 群体联合分析的统计功效明显高于这 两个群体单独分析的统计功效 。此外 ,即使两个群体联合分析时的样本容量与两个群体单独分析时的样本容量相 等 ,联合分析的统计功效亦明显高于单独分析的统计功效 。且随着遗传力和样本容量的提高 ,本方法的统计功效 逐步提高 。在参数估计的准确度和精确度上 ,相同的遗传力下 , F2 和 BC 群体联合分析普遍高于这 2 个群体的单 ( ) ( ) 独分析 ,尤其是在低遗传力 5 % 和较少样本容量下 50 ,这种优势更为明显 。且随着遗传力和样本容量的提高 , 各参数估计的准确度和精确度亦逐步提高 。为了验证本方法的效用 ,在全基因组水平进行了模拟分析 , 同样得到 了预期的结果 。 关键词 : 双亲本杂交 ;相关群体 ;Q TL 作图;极大似然方法 ( ) 中图分类号 :S5 12 ; S330 　　　　文献标识码 : A 　　　　文章编号 :1009104 1 2009 QTL Mapping in Multiple Related Populations Derived f rom Two Parents AO Yan , HU Zhiqiu , TANG Zaixiang , WANG Xuef eng , XU Chenwu (J iangsu Provincial Key L aboratory of Crop Genetics and Physiology , Yangzhou U niver sit y , Yangzhou 225009 , China) Abstract : Mo st of t he cur rent met ho ds for Q TL mapp ing are de signed for t he single segregatio n pop ulation derived f ro m t he cro ss of t wo inbred line s. Incorporating t he exi sting pop ulation s derived f ro m t wo p arent s may imp rove Q TL mapping an d Q TLba sed breeding p ro gram s. However , no general maximum likelihoo d met ho d ha s been