郏县红牛跨膜蛋白18 基因(TMEM18) SNPs 检测及其与生长性状的关联分析.pdf

Online system: http://www.j 农业 生 物 技 术 学 报 Journal of Agricultural Biotechnology 2013, 2 1(2): 173~178 DOI: 10.3969/j. issn.1674-7968.2013.02.006 研究报告 Letter 郏县红牛跨膜蛋白18 基因(TMEM18)SNPs 检测及其与生长性状的关联 分析 1 2 1 1 3 1* 马伟 马云 刘栋 高远 王居强 陈宏 1 西北农林科技大学动物科技学院，杨凌712100；2 信阳师范学院生 科学学院，信阳464000；3 河南省肉牛工程技术研究中心，郑州 450003 * 通讯作者，chehong1212@263.net 要 跨膜蛋白 18 基因 (Transmembrane protein 18, TMEM18) 在神经系统表达。全基因组关联分析 (GWAS)表明，该基因的突变会影响人类肥胖和Body Mass Index(BMI)值变化。本研究采用DNA 池测序 技术检测了郏县红牛 (Bos taurus) TMEM18 基因 5 个外显子和部分内含子区单核苷酸多态(single nucleotide polymorphism, SNP)位点，通过PCR-RFLP 技术对所发现的SNP 位点进行分型验证，然后分析 不同基因型与郏县红牛生长性状的关联性。结果表明，在郏县红牛TMEM18 基因上共发现了3 处新的 SNPs ：NW_003099175.1: g. 2303GA、g. 3835 GA 和g. 3865 AG(aa. GlySer) 。关联分析结果表明，郏县 红牛TMEM18 基因g. 2303GA 位点AA 型个体体高、体长、胸围和体重显著大于GG 型(P0.05)，郏县红 牛TMEM18 基因g. 3835 GA 位点AG 型个体胸围和体重显著大于AA 型(P0.05) 。研究结果提示，这两 个位点可作为郏县红牛品种体尺和体重生长性状选择的分子育种候选标记。 关键词 牛，TMEM18 因，SNP ，生长性状 SNPs Detection of Transmembrane Protein 18 Gene (TMEM18) and Its Asscoation with Growth Traits in Jiaxian Red Cattle(Bos taurus) MA Wei1 MA Yun2 LIU Dong1 GAO Yuan1 WANG Ju-Qiang3 CHEN Hong1* 1 College of Animal Science and Technology, Northwest Agriculture and Forestry University, Yangling 712100, China; 2 College of Life Science, Xinyang Normal University, Xinyang 464000, China; 3 Research Center of Cattle Engineering Technology in Henan, Zhengzhou 450003, China * Corresponding author, chehong1212@263.net Abstract Transmembrane protein 18 gene(TMEM18) is expressed in the central nervous system that has recently been linked to human obesity and body mass index (BMI) in genome wide association studies (GWAS). In this study,