第六章 酶工程酶的人工模拟_提纲_2016.pdf

第六章 酶的人工模拟 6.1 模拟酶的理论基础和策略 6.1.1 概述 天然酶的特点： 催化效率高 专一性强 反应条件温和 易受到多种物理、化学因素的影响而失活 提纯困难，价格昂贵，储存及应用环境要求苛刻 限制了酶的工业应用 人工模拟酶 • 在尽量接近生物条件下人工模拟自然酶的模型化合物。 研究人工模拟酶的意义：解决天然酶的缺点；合成更高效的酶 模拟酶的兴起 20 世纪大部分时期，科学家一直在利用模拟手段作为阐明自然界中生物 体行为的基础。 对酶功能的模拟是当今自然科学领域中的前沿课题之一。 20 世纪80 年代以来，化学家对利用简单的分子模型构建酶的特征进行了 深入研究。 经过长期努力，新的催化剂——模拟酶诞生！ 模拟酶的概念 基于酶中起主导作用的因素利用有机化学、生物化学等方法设计和合成的 一类较天然酶简单的非蛋白质分子或蛋白质分子，以这些分子作为模型来 模拟酶对其作用底物的结合和催化过程。 在分子水平上模拟酶活性部位的形状、大小及其微环境等结构特征，以及 酶的作用机理和立体化学等特性的一门科学。 模拟酶研究的主要方面 模拟酶的金属辅基 e.g.模拟过氧化氢酶分子中的铁卟啉辅基，合成了分解过氧化氢的酶模型：三亚 乙基四胺与三价铁离子的络合物 模拟酶的活性功能基 e.g.用乙烯基苯酚与乙烯基咪唑共聚合，合成了带有羟基和咪唑基的α-胰凝乳蛋 白酶模型 模拟酶的高分子作用方式 e.g.用相对分子质量为40000-60000 的聚亚乙基亚胺作为模型化合物的骨架，引 入10%摩尔的十二烷基和15%摩尔的咪唑基，合成一个硫酸酯酶模型 模拟酶与底物的作用 1 e.g. 合成冠醚化合物来模拟酶；冠醚的空穴尺寸对底物的选择性有影响 模拟酶的性状 e.g. 利用组氨酸的衍生物十四酰组氨酸与十六酰烷基-三甲基溴化铵组成两种分 子的混合微胶束，催化乙酸对硝基苯酯的水解，其速率比组氨酸的增加了100 倍 6.1.2 模拟酶的理论基础 1、酶学基础 根据Pauling 的稳定过渡态理论，酶的催化机制是酶先结合底物，进而选择 性地让底物稳定于某一特定反应的过渡态，降低反应的活化能，从而加快反应速 度。 2、主-客体化学和超分子化学基础 Pederson 、Cram 和Lehn 报道了一系列光学活性冠醚的合成方法。这些 冠醚可以作为主体与伯铵盐客体形成复合物。 Cram 提出主-客体化学：主体与客体通过配位键或其它次级键形成稳定复 合物的化学；体现为主体和客体在结合部位的空间及电子排列的互补。 Lehn 提出超分子化学：当受体与络合离子或分子结合成具有稳定结构和 性质的实体时，就形成了“超分子”，兼具分子识别、催化和选择性输 送的功能。 3、设计模拟酶 基于酶的作用机制 基于对简化的人工体系的识别、结合和催化的研究 模拟酶在结构上必须具有两个特殊部位: ①底物结合部位；②催化部位 在设计模拟酶之前，应对酶的结构和酶学性质有深入了解： 酶活性中心-底物复合物的结构 酶的专一性及其同底物结合的方式与能力 反应动力学及各中间物的知识 设计模拟酶 催化基团的定向引入对催化效率的提高至关重要 与底物定向结合的能力 能够在底物结合中，通过底物的定向、键的扭曲及变形来降低反应的活化 能 催化基团和底物之间必须具有相互匹配的立体化学特征 设计人工酶模型应考虑： 酶模型应为底物提供良好的微环境，便于与底物，特别是反应的过渡态以 离子键、氢键等结合 催化基团必须与结合点的底物的功能团相近似 酶模型应具有足够的水溶性，并在接近生理条件下保持其催化活性 6.2 模拟酶的分类和制备 小分子仿酶体系： 环糊精、冠醚、环番、环芳烃、卟啉等大环化合物