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　　简论物理系毕业论文格式模板示例 简论物理系毕业论文格式模板示例 导读：复杂、昂贵；且技术难度大等，无法在原子层次和飞秒分辨率下进行研究。用计算机模拟的理论方法研究蛋白质的高压去折叠是实验研究的有利补充，可以在原子层次和很高的时间分辨率上研究实验无法实现的新现象，对实验研究有重要的指导作用。分子动力学模拟可以从原子水平和飞秒分辨率上研究蛋白质的高压去折叠，这一点目前实 德州学院 物电学院 2014 届 物理学专业 一 毕 业 论 文（ 毕 业 设 计 ）二 选 Chignolin 蛋白的高压变性研究（题目：小二号黑体加黑） 王贞营（小四黑体）(德州学院物电学院，山东德州 253023)（院系：五号黑体） 摘 要 随着计算机模拟技术的发展，本文利用 GROMACS 软件，对 Chignolin 在 2000bar 和 10000bar 两个压强下进行的独立的分子动力学模拟，以揭示压强对蛋白质去折叠（变性）的影响并探讨其机理。 通过分析模拟结果发现： Chignolin 蛋白在高温下 RMSD 最大时去折叠程度明显不同;小蛋白随着压强的 增加其折叠与去折叠过程有一个反复阶段;高压下的蛋白质去折叠不是完全折叠;高压对 Chignolin 的构 象影响较大，变性明显，甚至出现了完全去折叠的情况。 关键词 Chignolin； 分子动力学模拟； 去折叠； 高压 （“摘要”和“关键词”字样用五号黑体字，后空一格用五号宋体字单倍行距打印摘要内容， “摘要”两字中间空两空格，关键词用五号宋体，每个关键词后用“；”再空两格。 摘要内容 在 200-300 字之间，不分段。 ） 1 绪论（一级标题：小三号黑体，顶格写）（正文部分均用小四号宋体，1.5 倍行距） 蛋白质是一切生命活动的主要物质基础，结构决定其功能。 蛋白质折叠和去折叠问 题是当前生物信息学、 生物物理学等生命科学领域面临的一项长期而具有极其重要地位的 课题。 其重要任务之一便是通过施加外界驱动力（如温度，压强，机械力等）来致使蛋白 质变性，通过研究其去折叠过程探索蛋白质的折叠和去折叠机制。 近年来随着实验手段和 计算机水平的不断提高，许多实验仪器和理论方法被用来研究蛋白质的折叠和去折叠过 程。 从实验上研究蛋白质高压去折叠存在着各种问题,如时间周期长，设备复杂、昂贵；且 技术难度大等，无法在原子层次和飞秒分辨率下进行研究。 用计算机模拟的理论方法研究 蛋白质的高压去折叠是实验研究的有利补充， 可以在原子层次和很高的时间分辨率上研究 实验无法实现的新现象，对实验研究有重要的指导作用。 分子动力学模拟可以从原子水平 和飞秒分辨率上研究蛋白质的高压去折叠，这一点目前实验上无法实现。 目前对蛋白质折 叠的研究采取的策略之一就是用加速去折叠过程来研究蛋白质的折叠问题。 蛋白质去折叠 可以通过诱导变性条件加速其进程，这样可以对蛋白质构象膨胀的早期阶段进行观察，而 这种过程在一定程度上反映了蛋白质的折叠过程[1] 。 蛋白质高压去折叠（变性）的研究是 当今蛋白质工程中还未完全解决的一项重要内容。 对温度导致去折叠过程已经进行了广泛 的研究,而对压强导致蛋白质去折叠（变性）的研究相对较少，仅做了少量的模拟研究[1]。 （页码居右下角） 1 德州学院 物电学院 2014 届 物理学专业 一 毕 3 4 5 6 7 8 9 10 简论物理系毕业论文格式模板示例 导读： 业 论 文（ 毕 业 设 计 ）二 选 上角标[1]：表示 简论物理系毕业论文格式模板示例 导读：定律：Fimiaimiri（2-2）（重要公式的标注：同图标，以章节为基础，如：2-1、2-2、…等）这里的Fi是所有其它粒子作用到粒子i上的合力，这可以由N个粒子的位能函数V的负梯度表示，即：VFiri（2-3）在笛卡尔座标中，可以用它的3个分量来表示。若Xi(t)是时刻t粒子i在x方向的座标。使用泰勒（Taylor）展开 顿第二定律： Fi mi ai mi ri （2-2） （重要公式的标注：同图标，以章节为基础，如：2-1、2-2、…等） 这里的 Fi 是所有其它粒子作用到粒子 i 上的合力，这可以由 N 个粒子的位能函数 V 的负梯度表示，即： V Fi ri （2-3） 在笛卡尔座标中，可以用它的 3 个分量来表示。 若 Xi(t)是时刻 t 粒子 i 在 x 方向的座 标。 使用泰勒（Taylor）展开，我们可以得到： (t )t X (t )t 2 / 2 .... X i (t t ) X i (t ) X i i (t )t X (t )t 2 / 2 .... X i (t t ) X i (t ) X i i （2-4） （2-5） (t )