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微卫星筛选办法课件
微卫星筛选方法Microsatellite isolation strategies;什么是微卫星(Microsatellite)? ;;完美(perfect)重复型;不完全(imperfect)重复型;;;传统筛选法;骆桨回冶尔诗鲁跪壹囊菏冕瑰嗓搅枉臃岸炯纯蝶慈韭获烩的暖福恨栽诛秧微卫星筛选方法课件微卫星筛选方法课件;传统筛选法;基于引物扩增的方法;基于引物扩增的方法;选择性杂交法;FLASCO法(Fast isolation by AFLP of Sequences COtaining repeats) ;1 DNA抽提
2 酶切连接
3 AFLP特异扩增
4 探针杂交
5 磁珠洗脱
6 双链恢复
7 质粒连接
;(1)DNA抽提
- Sambrook et al. 1989;其它方法
(2)酶切连接
- Mse I + T4 Ligase
(3)AFLP特异扩增DNA片段
- 酶切连接液为模板
- Mes I – N 引物
;(4)探针杂交
- 5,端生物素修饰的重复碱基探针与扩增产物杂交
(5)磁珠洗脱
- 磁珠特异性吸附杂交片段,洗脱除去未杂交片段
;(6) 双链??复
- 磁珠富集得到的目的单链以Mes I - N为引物特异扩增恢复为双链
(7) 质粒连接
- PMD18-T vector
;(8) 转化克隆
- DH5-α感受态细胞
涂板,37℃培养 11-13h
(9)单克隆扩增培养
- 挑取白色饱满菌落液体培养基培养5h
(10)菌落PCR选择目标克隆
- 三引物法
扩增产物为双带
;(11)测序
-目标克隆菌液测序
(12)引物设计及优化
- CID软件分析序列及设计引物
- 引物扩增条件优化
(13)荧光PCR及基因分型
- 荧光修饰引物特异扩增
- 基因分型
;(14)数据分析
- Genescan 读取基因分型数据
- 位点多态性信息
- 位点是否偏离哈温平衡
- 位点是否连锁不平衡;淘金成功!!;谢谢!
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