野禽源AIV PB1-F2基因的克隆与遗传进化及部分氨基酸位点分析.pdfVIP

摘要 摘要 完成此14株AⅣPBI．F2基因克隆、测序的基础上，对其进行了同源性、遗传进化关系 及氨基酸编码特征的比较分析。我们发现H5N1亚型高致病性毒株 A／lesser Vlrus Influenza 也为了使我们的研究更加全面、深入，从NCBI 差异，而且还呈现出了一定的规律和特点；H9N2亚型毒株：表现出了较强的时间和空 间分布特征，我们根据H9N2亚型与其它亚型AIV在此三个氨基酸位点上的异同，将其 分为H5N1．1ike型和Other 明在其漫长的遗传演化进程中，PBl．F2已经形成了多条遗传进化分支，具体表现为 H5N1及香港系毒株较其它AIV存在较远的遗传距离。随机的突变和重组似乎不足以解 释这种差异及遗传距离形成的原因，其生物学意义有待于进一步的探讨。 关键词野禽源禽流感病毒；PBl．F2基因；序列测定；遗传进化与氨基酸组成分析 Abstract Abstract Withthe discoveredInfluenzaAVirusPBl-F2Proteinastheresearch recently object， basedonthe of and PB1-F2 ofavianinfluenzaviruses completioncloningsequencinggenes from14wild the onthe (arc)isolatedbirds，we performedanalysis 011these the the and of codedaminoacids．Wefoundthe relationshipsgenes composition aminoacids ofPBl-F2were 37，48，50 ina H5N1 avianinfluenza respectively hi．ghpathogenic wasdifferentfromthatofother13low A／lesser_kestrel／Harbin／194／2007(H5N1)，which avian influenza pathogenic further this 061 AWstrainsPB1- aspartate《Asp，D)respectively．Forexploringphenomenon，1 F2 whichdownloadfromNCBIInfluenzaWmmResourcewere geneticsequences compared， theresultsshowedthatallofthenon-H9N2AWs：97 H5N1 subtype HongKong subtype，the otherH5N1 andtheother ofAⅣwereobviousdifferentintheaminoacid subtype subtypes of