加州大学柏克莱分校劳伦斯柏克莱国家试验室基因体-台中荣民总医院.PDF

出國報告（出國類別：進修） 加州大學柏克萊分校 勞倫斯柏克萊國家實驗室 基因體學進修報告 服務機關：台中榮民總醫院 姓名職稱：劉伯瑜 醫師 派赴國家：美國 出國期間：August, 2014 ~ July, 2015 報告日期：104 09 07 摘要 感染症對許多國家而言，是嚴肅的國安議題。 不論是新興傳染病或是抗生素 的抗藥性，有效的研究與防治都需要大量高品質的基因體相關數據。 基因體的定序、序列組裝與功能註解，整道生產線都需要精細繁複的基礎建 設，才能得到高品質的基因體數據。 包括檢體的收集、基因庫的製備、定序等 等，都需要嚴格的品管監控與不斷的流程改善，很多時候甚至需要修改原先廠 商的設計以求得最佳化的實驗結果。 對於定序後的數據，生物資訊部門的參與 更是不可或缺。 在許多基因體組裝與功能註解的策略上，常常需要不同部門的 良好溝通才能產出最適合研究者所需的資料。 近年來，基因體學不僅以＂讀取＂為滿足，更進一步開始＂寫入＂。 DNA 合成技術讓我們能更精確的分析許多基因的功能，甚至在無法培養的微生物上。 整合總體基因體、單細胞基因體，在目前將是發現自然界次級產物與其功能最 有效的研發模式， 進而重建整個代謝途徑。新一代基因編輯技術的技術，更 能在活體細胞上進行基因編輯，未來發展不可限量。 2 目 次 出國報告提要……………………………………………………………1 內容摘要………………………………………………………………… 2 報告內文………………………………………………………………… 4 建議事項…………………………………………………………………9 3 報告 目的 此次進修的主要目的為基因體學的最新發展與應用。 進修地點是美國的勞倫斯柏克萊國家 實驗室。 勞倫斯柏克萊國家實驗室 （Lawrence Berkeley National Laboratory）是美國聯邦政府 設立的國家實驗室，由加州大學柏克萊分校代管。 單位內有 13 位諾貝爾獎得主， 2014 會 計年度預算為 7 億五千萬美元，現有 3232 名員工。 早期實驗室為發展粒子回旋加速器，及 其後的核子武器計畫，需要大量科際整合而組成。 也因此團隊合作一直是 Berkeley Laboratory 的傳統。 在二戰期間主要的貢獻包括原子彈、雷達與近接信管的發明。 戰後，Berkeley Laboratory 依然與軍方及產業維持良好的合作，並將觸角擴及更多研究領域。 冷戰時期，為 了分散風險，Berkeley Laboratory 開始轉型為以非機密 (Unclassified) 的研究為主。 機密的研 究則逐漸移轉至新墨西哥州的 Los Alamos