rna二级结构图亏格的动态生成计算法 dynamic generation method for calculating genus of rna secondary structure graph.pdfVIP

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2017-10-15 发布于上海
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rna二级结构图亏格的动态生成计算法 dynamic generation method for calculating genus of rna secondary structure graph.pdf

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rna二级结构图亏格的动态生成计算法 dynamic generation method for calculating genus of rna secondary structure graph

EngineeringandApplications计算机工程与应用 Computer RNA二级结构图亏格的动态生成计算法高世乐1，王启钊2 GAOShilel．WANG Oizha02 1 1．华侨大学信息管理与信息系统系，福建泉州36202 1 2．华侨大学分子药物学研究所，福建泉州36202 ofInformation 36202 1，China University，Quanzhou，Fujian 1．Department ManagementSystem，Huaqiao 2．InstituteofMolecular 36202 l，China Medicine，HuaqiaoUniversity,Quanzhou，Fujian GAO methodfor ofRNA structure Shile，WANG secondary Qizhao．Dynamicgeneration calculatinggenus and Engineering graph．Computer Applications，2012，4s(zz)：26—31． arc and Abstract：A methodis basedon ofRivas dynamicgeneration presented graphgrammars withthe method classtocalculatethe ofRNA structure determinant secondary genus secondarygraph．Comparing for method hastwo firstoneisthe oftheeffi— calculatinggenus，thepresentedmainly advantages：the improvement oneisthe ofthe ofRNA structures． of second calculation，the generationmini-genusgraphs secondary ciencygenus Key secondarystructures；topologicalclassification；genus words：pseudoknots；RNA 摘成算法。与已有的基于判定的亏格计算方法相比，该算法的优点主要有两点：一是提高了计算亏格的效率，二是可以实现枚举小亏格RNA二级结构图。关键涧：假结；l州A二级结构；拓扑分类；亏格文章编号：1002．833I(2012)11-0026—06文献标识码：A 中图分类号：TP301．2；Q71；0157．6 l 简介