分子结构与基因序列数据综合可视化方法研究 research on comprehensive visualization method of molecular structure and gene sequence data.pdfVIP

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2017-10-15 发布于上海
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分子结构与基因序列数据综合可视化方法研究 research on comprehensive visualization method of molecular structure and gene sequence data.pdf

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分子结构与基因序列数据综合可视化方法研究 research on comprehensive visualization method of molecular structure and gene sequence data

CN43一1258／TP 计算机工程与科学第35卷第12期2013年12月 ISSN1007—130X 8．Science V01．35．NO．12，Dee．2013 ComputerEngineering 文章编号：1007一130X(2013)12-0026—08 分子结构与基因序列数据综合可视化方法研究宋成龙，邹辰，王文珂，李思昆 (国防科学技术大学高性能计算国家重点实验室，湖南长沙410073) 摘要：随着系统生物学的兴起和迅速发展，为了探索不同生物层次信息之间的关联关系，对不同层次生物科学计算数据综合可视化的需求日益迫切。提出了一种通过构建集成框架实现分子结构与基因组序列数据的综合可视化方法。综合可视化集成框架可实现不同层次可视化工具统一管理以及统一用户交互界面，通过定义关联数据描述方法，建立已有的分子结构与基因组序列数据间的关联性，有效支持分子结构数据与基因序列数据的综合可视化功能开发。应用该方法开发了一个分子结构数据与基因序列数据综合可视化原型系统，实现了分子结构数据与基因序列数据的同步显示、基因片段与相应分子局部空间结构综合显示等综合可视化功能。初步应用与分析表明，所提出的综合集成可视化方法扩展性好，所实现的综合可视化功能在研究分子结构及基因序列数据关联关系中具有良好的应用前景。关键词：科学可视化；分子结构可视化；基因序列可视化；综合可视化；集成框架；数据关联中图分类号：TP391．9 文献标志码：A doi：10．3969／j．issn．1007—130X．2013．12．005 ～ l ● ● l■ ·‘ ■ J’ 1 OU VisUalizatiOnmetIIOd Researcn comprehensive ofmolecularstructureand data sequence gene SONG Chen，WANGWen—ke，LISi—kun Cheng—long，ZOU (State of Performance ofDefense 410073，China) KeyLaboratoryHigh Computing，NationalUniversity Technology，Changsha Abstract：Withtheriseandthe of orderto therela— rapiddevelopmentsystembiology，in explore levels needof visualizationof betweendifferentofBioinformaticsrelevance，the tionship comprehensive scientific dataatdifferentlevelsis methodof an biological computing increasinglyurgent．