识别子设计最佳化及基因晶片应用之研究.PDF

行政院國家科學委員會專題研究計畫 成果報告 識別子設計最佳化及基因晶片應用之研究 計畫類別： 個別型計畫 計畫編號： NSC91-2622-E-002-035-CC3 執行期間： 91 年06月 01日至 92 年05月 31日 執行單位：國立臺灣大學資訊工程學系暨研究所 計畫主持人： 高成炎 計畫參與人員： 陳權忠,黃友正 ,黃崇隆 ,黃玟憲 , 蕭子昌, 陳士傑 報告類型： 完整報告 處理方式： 本計畫為提升產業技術及人才培育研究計畫，不提供公開查詢 中 華 民 國 92 年8月 15日 國科會補助提升產業技術及人才培育研究計畫成果精 簡報告 學門領域：資訊 計畫名稱：識別子設計最佳化及基因晶片應用之研究 計畫編號： NSC91-2622-E-002-035-CC3 執行期間20030531 執行單位：國立臺灣大學資訊工程學系暨研究所 主 持 人：高成炎 參與學生： 姓 名 年 級 已發表論文或已申請之專利 工作內容 ( 大學部、碩士 含大學部專題研究論文、碩博士論文( ) 班、博士班) 陳權忠 碩二 Efficient Primer design 研發及設計 algorithm with partial order 黃友正 碩一 graphs, ISMB2003. 黃崇隆 碩二 研發及設計 黃玟憲 碩二 協助設計開發 蕭子昌 碩二 協助設計開發 陳士傑 碩二 研發及設計 合作企業簡介 合作企業名稱：百恩諾生物科技股份有限公司 計畫聯絡人：陳麗貞 資本額： 27,580,000 產品簡介：微陣列生物晶片生產 網址：.tw 電話： (02 ext:114 研究摘要： 基因晶片(DNA Chip)應用的起源是因為成千上萬的基因所形成的產物為構 成生命最基本的要素，故發展出以鹼基配對(base pairing)與核甘酸雜交(nucleotide hybridization)原理為基礎的技術。其原理是由 1962 年諾貝爾獎得主華生(J. Watson)和克里克(F.H. Crick)所建構 DNA 分子模型，遵循A-T 與C-G 互補配對 規則，A鹼基與配對股 (complimentary strain)的 T鹼基結合，而 C鹼基會與配對 股 (complimentary strain)的 G鹼基結合。基因晶片 (DNA Chip)利用此項原理， 將 設計好的探針 (probe) 以不同的方式排列固定在晶片上，使得樣本能夠與其反應， 並產生具特異性的雜交結果，其中識別子(primer)的設計亦是此項技術實驗所需 的核心關鍵。隨著後基因體時代的來臨，各物種的基因陸續被一一定序出來，尤 其是人類基因的定序，被視為是未來生物醫療方面的重要里程碑，定序完成只提 供一窺遺傳密碼全貌的機會，欲瞭解與應用基因資訊，最重要的還是了解其功 能，人類的功能基因 (functional genes) 控制人類疾病、遺傳、行為等生理現象， 探索基因的功能及其間之交互作用，過去的傳統生物學卻只能研究觀察數量很少 的基因表現量，尋找基因、探索其功能更有如大海撈針般困難。而識別子 (primer) 的設計也在生物實驗中扮演著舉足輕重的角色，將微量的基因 (DNA)放