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                SUMMIT软件应用及数据处理
                    SUMMIT软件
一  打开SUMMIT软件
1 双击电脑桌面上的SUMMIT软件的快捷键,显示出 SELECT DATABASE对话框。
2 从下拉菜单中选择MOFLO XDP,与主机进行连接。也可以用该软件进行离线数据的分析。
二创建一个新的数据库
  数据库是方案,样本以及数据的集合,打开一个新的数据库后会出现一个工作区,在工作区里可以创建直方图和点图,也可以打开已有的方案。
1 打开SUMMIT软件,点击NEW出现CREATE DATABASE的对话框。
2 选择要保存数据库的文件夹,输入名字,点击SAVE。进入到SUMMIT软件主屏。
1 主菜单     2 控制面板     3  额外菜单    4 额外菜单   5  工作区   6  工具栏
控制面板
软件中的大部分操作可以通过控制面板进入,上面有几个按钮,每个按钮代表一个菜单,在它下面还有次级菜单。
三INSTRUMENTTab,当连接到自动进样是会出现,手动进样没有。
四Aquisition Tab 可以定义将要获取的文件类型,可以设置样本运行的信息,看到样本运行的统计。    
获取样本面板可以显示合保存一个样本的信息。如下图
修改样本的信息:
1 点击上图1 号位的蓝色图标,选择EDIT VIEW,该区域就可以进行修改了。再点击一次EDIT VIEW就可以回到以前状态。
2 在VALUE栏下,改变信息。
3 选择ADD KEYWORD,可以增加NAME,VALUE,键入新信息,点击OK。
选择参数
在建立直方图和点图之前要选择用于实验的参数。
1 点击Acquisition Tab,在左下方出现Acquisition Parameter的面板。
2 双击Disable单词,选择想要进行收集的参数。
  H= 线形高度信号    L= 对数高度信号   A= 线形面积信号  W= 脉冲宽度  
LA= 对数面积
打开已有的方案
选择FILE〉PROTOCOL〉LOAD,选择一个已经保存过方案,点击OPEN。
建立新方案
1选择FILE〉PROTOCOL〉NEW,会出现一个新的工作区。
2 确保已经选择好了参数。
3 创建点图和直方图。
改变方案
在方案工具栏上,从下来菜单中选择一个新方案。(只要当前数据库中的方案才会出现在下拉菜单中)。
获取数据
点击键盘上的F2 键开始收集数据,再按一次F2 ,停止收集。(如果使用自动上样,先确证一下Instrument Tab下的设置。
保存获取的数据
点击F3键保存,输入文件名。也可以点击Acquisition下拉菜单,选择Auto Save,则获取停止后自动保存。
循环模式(Cycle Mode)只显示收集过程中最近的数据,主要用于仪器调校。
1点击Acquisition下拉菜单,选择Cycle Amount,设置数据循环的数目,点击OK。
2点击Acquisition下拉菜单,选择Cycle或点击屏幕右侧的Cycle Mode图标。
3 重新进行获取,循环模式生效。
五 Sort Tab  用于设置分选门。
建立或修改分选门
在设置分选门之前要获取要分选的样本数据,设置一个或多个区域来定义用于分选的细胞群。
1 在Sort Logic and Statistic面板上,点击菜单图标,选择NEW Decision。
2 双击要建立或修改的液流,进行修改。
六 SampleTab  显示选择样本的参数,该状态下可以进行数据的颜色补偿。
数据的颜色补偿
 在Compensation的面板上,点击菜单图标,选择Auto Load from Sample,当打开一个数据文件时会自动出现Compensation Matrix 。
单染样本自动补偿向导
1 上阴性对照或同型对照样本,调节电压。
2 上单染的对照样本,保存数据文件。
3 把所有单染样本的文件放到实验文件夹中。
4 点击SampleTab。
5 建立用于校正补偿的点图,进行补偿的参数要放到X轴上。
6 点击点图上左上角的蓝色图标,然后点击下拉菜单下的Auto Compensate
7在Compensation的面板上,点击菜单图标,选择Auto Compensate,出现Auto Comp Sample对话框。
在Gate中选择合适的门,在Experiment中选择包含单染样本文件的文件夹,然后选择所有用于补偿的文件,点击OK。
8 这时就会创建一个新的标有AutoComp的工作区,显示第一组点图。每一张点图都会把单染的荧光通道放在X轴上,而需要进行补偿的参数放在Y轴上。显示默认的自动补偿的Dim和Bright 区域,如果选择了门关联,它会应用到每个点图上。Auto Copmensate向导会出现。
9 检查每一张点图的% His 统计。如果Dim或Bright
                
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