肺癌全基因组关联研究的进展.doc

  肺癌全基因组关联研究的进展# * 5 10 15 20 25 30 35 40 摘要：由于持续增长的烟草消费和严重的环境污染，我国多数地区的肺癌发病率和死亡率一 直呈上升趋势，成为严重危害我国居民健康和生命的主要疾病之一。肺癌的发生发展是环境 因 素 与 遗 传 因 素 共 同 作 用 的 结 果 ， 遗 传 因 素 包 括 单 核 苷 酸 多 态 性 (Single nucleotide polymorphism，SNP)。过去以通路为基础的 SNP 研究策略存在多种不足，导致结果重现性 差，相比之下，全基因组关联研究(Genome-wide association study，GWAS)则具有很多的优 势，发现了很多肺癌的遗传易感性位点。本文即对肺癌全基因组关联研究的进展做一综述。 关键词：流行病学；肺癌；全基因组关联研究 中图分类号：R18 Progress in Genome-wide Association Studies of Lung Cancer Dong Jing, Cao Songyu, Ma Hongxia, Jin Guangfu, Hu Zhibin, Shen Hongbing (Department of Epidemiology and Biostatisticschool of Public Health, Nanjing Medical University, Nanjing 211166) Abstract: In China, the morbidity and mortality of lung cancer have been increasing rapidly in last two decades, which is believed to be mainly due to continuous increases in tobacco consumption and environmental pollution. The occurrence mechanism of lung cancer is related to alteration of environmental and genetic factors, including single nucleotide polymorphisms. Compared to the research strategy of candidate gene , genome-wide association studies has much more advantages. This paper summarized the development and progress in lung cancer genome-wide association studies. Key words: epidemiology; lung cancer; genome-wide association study 0 引言 肺癌是全球最常见的恶性肿瘤之一，在工业化国家和我国许多城市已位居全部恶性肿瘤 死因的首位。由于持续增长的烟草消费和环境污染，我国多数地区的肺癌发病率和死亡率一 直呈上升趋势，成为严重危害我国居民健康和生命的主要疾病之一。流行病学研究表明，肺 癌的发生是环境因素和遗传因素共同作用的结果，尽管 80%以上的肺癌可归咎于烟草暴露， 但在相同的烟草暴露下，仅不到 20%的吸烟者发展为肺癌，提示不同个体对肺癌存在遗传 易感性，主要是单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism，SNP)。过去 10 余年间，研 究者在肺癌遗传易感性方面进行了大量的关联研究，由于早期基因分型技术不成熟和基因组 变异信息缺乏，关联研究主要是采用候选基因策略，即将研究的重点集中于影响肺癌发生的 重要通路/基因，如代谢、DNA 修复、凋亡和细胞周期调控等通路，但是由于样本量较小、 研究设计参差不齐、研究结果缺乏验证，导致这些研究结果重现性差，真正与肺癌易感性建 立明确关联的基因变异很少。尽管这些研究结果对于阐明肺癌的遗传易感机制还有相当大的 -1-   差距，但其对于整个相关研究领域的推动是极其显著的，技术方法和研究资源均在短短 10 多年时间内发生了巨大的变化。随着人类基因组图谱(HGP)和单倍型图谱(HapMap)的构建， 相关基因多态数据的不断完善，能够覆盖整个候选基因/区域，甚至是全基因组的标签 SNP 45 50 55 60 65 70 75 (Tagging SNP，tSNP)研究策略得到研究者推崇。全基因组关联研究(Genome-wide association study，GWAS)的